Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
PL 65 (Viikinkaari 1)
00014
Finland
Viikinkaari 1, Biocentre 3
00790 Helsinki
Finland
Forskningsoutput per år
Forest Tree Cambial Research (FORCAM) group
Lateral growth in plants originates from the vascular cambium, where stem cells are located. Cambium provides thickness to plant organs by generating conductive tissues - xylem (wood) toward the center and phloem toward the organ periphery. Vascular development continues as long as the plant grows, and proliferation and differentiation of these tissues from the cambium is controlled not only laterally but also along the plant body. As of January 2022, I have started establishing my independent research group at the University of Helsinki. In my research I am interested in understanding molecular mechanisms that regulate cambial development, lateral growth and vascular continuity in plants using tree (poplar and birch) stems and Arabidopsis roots as model systems.
Project overviews
Through a functional genomics approach, we have identified several novel transcription factors (TFs) that are activated by the plant hormone cytokinin, an enhancer of cambial cell division rate and lateral growth in plants. Currently we are exploring how these TFs regulate thickening of plant organs both in hybrid aspen trees and Arabidopsis roots using state-of-the-art molecular biology tools, such as knocking them out via CRISPR-Cas9 or tissue specific inducible overexpression and (live) confocal imaging.
We also would like to study how trees respond to local changes in cambial activity in short and long term and how vascular continuity and physiology along the tree trunk is affected from these changes. For this purpose, we are designing an innovative new system to genetically inhibit lateral growth at different heights along the plant body through inducible knockout of a cambial factor.
Finally, we would like to identify more key loci driving enhanced growth and carbon sink in trees through comparative single cell transcriptome analysis of Arabidopsis, birch and poplar and test systematically the roles of different candidate genes.
Supervision
Teaching
Plant Developmental and Molecular Biology, Doc, Helsingfors universitet
Tilldelningsdatum: 4 juni 2024
Biologi, PhD, SLU, Umea Plant Sci Ctr, Dept Forest Genet & Plant Physiol
Tilldelningsdatum: 27 nov. 2015
Molecular Biology, MSc, Umeå University
Tilldelningsdatum: 13 aug. 2009
Molecular Biology and Genetics, BSc, Istanbul Technical University
Tilldelningsdatum: 8 feb. 2008
Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig › Peer review
Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Bidrag till uppslagsverk/ordbok › Vetenskaplig › Peer review
Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Ledare › Vetenskaplig
Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Kommentar/debatt › Vetenskaplig › Peer review
Hölttä, T. (Projektledare), Kucukoglu Topcu, M. (Projektledare), Mähönen, A. P. (Projektledare), Waszczak, C. (Projektledare), Iida, H. (deltagare), Lyytikäinen, M. (deltagare), Räsänen, M. (deltagare), Wang, M. (deltagare), Wang, X. (deltagare), Woodward, G. M. (deltagare) & Wybouw, B. (deltagare)
01/01/2024 → 31/12/2026
Projekt: Dinlands Akademi: Spetsforskningsenhet
Kucukoglu Topcu, M. (Projektledare), Blomster, T. (deltagare), Fatz, W. (deltagare), Koukkari, E. I. (deltagare) & Lyytikäinen, M. (deltagare)
01/09/2022 → 31/12/2025
Projekt: Finlands Akademi: Akademiforskarens forskningskostnader
Kucukoglu Topcu, M. (Projektledare) & Fatz, W. (deltagare)
01/09/2022 → 31/08/2027
Projekt: Finlands Akademi: Akademiforskare
Helariutta, Y. (Principal Investigator), Kangasjärvi, J. (Co-Principal Investigator), Mähönen, A. P. (Co-Principal Investigator), Hölttä, T. (Deltagare), Pyhäjärvi, T. S. (Deltagare), Salojärvi, J. (Deltagare), Nieminen, K. (Deltagare), Shapiguzov, A. (Deltagare), Kucukoglu Topcu, M. (Deltagare), Sierla, M. (Deltagare), Waszczak, C. (Deltagare) & Vaten, A. (Deltagare)
01/01/2022 → 31/01/2029
Projekt: Forskningsprojekt
Kucukoglu Topcu, M. (Projektledare)
Suomen Akatemia Projektilaskutus
01/05/2025 → 31/08/2027
Projekt: Finlands Akademi: Akademiforskarens forskningskostnader
Kucukoglu, M. (!!Recipient), 3 mars 2020
Pris: Pris och hedersbetygelser
Kucukoglu, M. (!!Recipient), 2018
Pris: Pris och hedersbetygelser
Kucukoglu Topcu, M. (!!Recipient), 27 aug. 2015
Pris: Pris och hedersbetygelser
Kucukoglu Topcu, M. (!!Recipient), juli 2012
Pris: Pris och hedersbetygelser
Kucukoglu Topcu, M. (!!Recipient), juni 2011
Pris: Pris och hedersbetygelser
Kucukoglu Topcu, M. (Närvarande)
Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
Kucukoglu Topcu, M. (Närvarande)
Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
Kucukoglu, M. (Närvarande)
Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
Kucukoglu Topcu, M. (Besökande forskare)
Aktivitet: Typer för besök till extern institution › Akademisk besök på annan institution
Kucukoglu, M. (Närvarande)
Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium