Om du gjort några ändringar i Pure kommer de visas här snart.

Personlig profil

Information om forskning och undervisning

Our research is focused on molecular biology and functional genomics of non-pathogenic (dairy starters, probiotic lactobacilli, propionibacteria) and pathogenic bacteria (streptococci, staphylococci) that are adapted to food-environment.

We exploit gene and omics-level approaches combined with microbiological and biochemical analyses to study cell-physiology in beneficial and pathogenic bacteria in diverse food systems and materials. The ultimate goal of these research projects is to provide novel information to gain maximal benefit of beneficial bacteria as well as to combat pathogens in foods.

Keywords

  • 416 Livsmedelsvetenskap
  • 412 Djursvetenskap, mjölkproduktlära
  • 1183 Växtbiologi, mikrobiologi, virologi
  • 1182 Biokemi, cell- och molekylärbiologi

Internationellt och inhemskt samarbete Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.

Publikationer 1994 2019

Growth Mode and Carbon Source Impact the Surfaceome Dynamics of Lactobacillus rhamnosus GG

Savijoki, K., Nyman, T. A., Kainulainen, V., Miettinen, I., Siljamäki, P., Fallarero, A., Sandholm, J., Satokari, R. & Varmanen, P., 5 jun 2019, I : Frontiers in Microbiology. 10, 17 s., 1272.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Acidipropionibacterium virtanenii sp. nov., isolated from malted barley

Deptula, P., Smolander, O-P. A., Laine, P. K. S., Roberts, R. J., Edelmann, J. M., Peltola, P., Piironen, V. I., Paulin, L. G., Storgårds, E., Savijoki, K., Laitila, A., Auvinen, P. O. V. & Varmanen, P. K., okt 2018, I : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 68, 10, s. 3175-3183 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

De novo assembly of genomes from long sequence reads reveals uncharted territories of Propionibacterium freudenreichii

Deptula, P., Laine, P. K., Roberts, R. J., Smolander, O-P., Vihinen, H., Piironen, V., Paulin, L., Jokitalo, E., Savijoki, K., Auvinen, P. & Varmanen, P., 16 okt 2017, I : BMC Genomics. 18, 24 s., 790.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Genomics and Proteomics Provide New Insight into the Commensal and Pathogenic Lifestyles of Bovine- and Human-Associated Staphylococcus epidermidis Strains

Savijoki, K., Iivanainen, A., Siljamaki, P., Laine, P. K., Paulin, L., Karonen (os. Miettinen), T., Pyörälä, S., Kankainen, M., Nyman, T. A., Salomaki, T., Koskinen, P., Holm, L., Simojoki, H., Taponen, S., Sukura, A., Kalkkinen, N., Auvinen, P. & Varmanen, P., aug 2014, I : Journal of Proteome Research. 13, 8, s. 3748-3762 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Projekter 2004 2020

Aktiviteter 2002 2018

Review of PhD-thesis

Pekka Varmanen (Förhandsgranskare)
2018

Aktivitet: ExaminationstyperMedlem i doktorsavhandlingskommitté

12th International Symposium on Lactic Acid Bacteria

Pekka Varmanen (Poster presentation)
27 aug 201731 aug 2017

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium

Review of a research project -proposals

Pekka Varmanen (Deltagare)
2017

Aktivitet: Andra aktivitetstyperAnnan

Review of a research project -proposals

Pekka Varmanen (Deltagare)
2016

Aktivitet: Andra aktivitetstyperTyper av övriga aktiviteter - Övrigt

Microbial biofilms: environmental, pharmaceutical, medical & industrial research in Finland

Pekka Varmanen (Talare: Presentation)
26 jan 2016

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium