Petri Törönen

Epigenome-450K-wide methylation signatures of active cigarette smoking: The Young Finns Study

Mishra, P. P., Hänninen, I., Raitoharju, E., Marttila, S., Mishra, B. H., Mononen, N., Kähönen, M., Hurme, M., Raitakari, O., Törönen, P., Holm, L. & Lehtimaki, T., 7 jul 2020, I : Bioscience Reports. 40, 7, 14 s., 20200596.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Molecular Fingerprint and Developmental Regulation of the Tegmental GABAergic and Glutamatergic Neurons Derived from the Anterior Hindbrain

Morello, F., Borshagovski, D., Survila, M., Tikker, L., Sadik-Ogli, S., Kirjavainen, A., Estartús, N., Knaapi, L., Lahti, L., Törönen, P., Mazutis, L., Delogu, A., Salminen, M., Achim, K. & Partanen, J., 13 okt 2020, I : Cell Reports. 33, 2, 26 s., 108268.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Novel comparison of evaluation metrics for gene ontology classifiers reveals drastic performance differences

Plyusnin, I., Holm, L. & Toronen, P., nov 2019, I : PLoS Computational Biology. 15, 11, 27 s., 1007419.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

The CAFA challenge reports improved protein function prediction and new functional annotations for hundreds of genes through experimental screens

Zhou, N., Jiang, Y., Bergquist, T. R., Lee, A. J., Kacsoh, B. Z., Crocker, A. W., Lewis, K. A., Georghiou, G., Nguyen, H. N., Hamid, M. N., Davis, L., Dogan, T., Atalay, V., Rifaioglu, A. S., Dalkiran, A., Atalay, R. C., Zhang, C., Hurto, R. L., Freddolino, P. L., Zhang, Y. & 147 andra, Bhat, P., Supek, F., Fernandez, J. M., Gemovic, B., Perovic, V. R., Davidovic, R. S., Sumonja, N., Veljkovic, N., Asgari, E., Mofrad, M. R. K., Profiti, G., Savojardo, C., Martelli, P. L., Casadio, R., Boecker, F., Schoof, H., Kahanda, I., Thurlby, N., McHardy, A. C., Renaux, A., Saidi, R., Gough, J., Freitas, A. A., Antczak, M., Fabris, F., Wass, M. N., Hou, J., Cheng, J., Wang, Z., Romero, A. E., Paccanaro, A., Yang, H., Goldberg, T., Zhao, C., Holm, L., Törönen, P., Medlar, A. J., Zosa, E., Borukhov, I., Novikov, I., Wilkins, A., Lichtarge, O., Chi, P-H., Tseng, W-C., Linial, M., Rose, P. W., Dessimoz, C., Vidulin, V., Dzeroski, S., Sillitoe, I., Das, S., Lees, J. G., Jones, D. T., Wan, C., Cozzetto, D., Fa, R., Torres, M., Vesztrocy, A. W., Rodriguez, J. M., Tress, M. L., Frasca, M., Notaro, M., Grossi, G., Petrini, A., Re, M., Valentini, G., Mesiti, M., Roche, D. B., Reeb, J., Ritchie, D. W., Aridhi, S., Alborzi, S. Z., Devignes, M-D., Koo, D. C. E., Bonneau, R., Gligorijevic, V., Barot, M., Fang, H., Toppo, S., Lavezzo, E., Falda, M., Berselli, M., Tosatto, S. C. E., Carraro, M., Piovesan, D., Rehman, H. U., Mao, Q., Zhang, S., Vucetic, S., Black, G. S., Jo, D., Suh, E., Dayton, J. B., Larsen, D. J., Omdahl, A. R., McGuffin, L. J., Brackenridge, D. A., Babbitt, P. C., Yunes, J. M., Fontana, P., Zhang, F., Zhu, S., You, R., Zhang, Z., Dai, S., Yao, S., Tian, W., Cao, R., Chandler, C., Amezola, M., Johnson, D., Chang, J-M., Liao, W-H., Liu, Y-W., Pascarelli, S., Frank, Y., Hoehndorf, R., Kulmanov, M., Boudellioua, I., Politano, G., Di Carlo, S., Benso, A., Hakala, K., Ginter, F., Mehryary, F., Kaewphan, S., Bjorne, J., Moen, H., Tolvanen, M. E. E., Salakoski, T., Kihara, D., Jain, A., Smuc, T., Altenhoff, A., Ben-Hur, A., Rost, B., Brenner, S. E., Orengo, C. A., Jeffery, C. J., Bosco, G., Hogan, D. A., Martin, M. J., O'Donovan, C., Mooney, S. D., Greene, C. S., Radivojac, P. & Friedberg, I., 19 nov 2019, I : Genome Biology. 20, 1, 23 s., 244.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

AAI-profiler: fast proteome-wide exploratory analysis reveals taxonomic identity, misclassification and contamination

Medlar, A. J., Törönen, P. & Holm, L., 2 jul 2018, I : Nucleic Acids Research. 46, W1, s. W479-W485 7 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review