Soili Kytölä

2024

Impact of Primary Tumor Location on Demographics, Resectability, Outcomes, and Quality of Life in Finnish Metastatic Colorectal Cancer Patients (Subgroup Analysis of the RAXO Study)

Aho, S., Osterlund, E., Ristimäki, A., Nieminen, L., Sundström, J., Mäkinen, M. J., Kuopio, T., Kytölä, S., Ålgars, A., Ristamäki, R., Heervä, E., Kallio, R., Halonen, P., Soveri, L. M., Nordin, A., Uutela, A., Salminen, T., Stedt, H., Lamminmäki, A. & Muhonen, T. & 6 andra, Kononen, J., Glimelius, B., Isoniemi, H., Lehto, J. T., Lehtomäki, K. & Osterlund, P., mars 2024, I: Cancers. 16, 5, 1052.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Laajojen kliinisten sekvensointitutkimuksien bioinformatiikka nyt ja tulevaisuudessa

Kankainen, M. & Kytölä, S., 2024, I: Duodecim. 140, 2, s. 173-182 10 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

Next-generation sequencing improves diagnostic accuracy of imaging and carcinoembryonic antigen alone for pancreatic cystic neoplasms

Belfrage, H., Boyd, S., Louhimo, J., Kytölä, S., Johansson, K., Tenca, A., Puustinen, L., Kokkola, A., Arkkila, P., Arola, J. & Seppänen, H., 2024, (!!E-pub ahead of print) I: Pancreatology. 10 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

NGS of brush cytology samples improves the detection of high-grade dysplasia and cholangiocarcinoma in patients with primary sclerosing cholangitis: A retrospective and prospective study

Boyd, S., Mustamäki, T., Sjöblom, N., Nordin, A., Tenca, A., Jokelainen, K., Rantapero, T., Liuksiala, T., Lahtinen, L., Kuopio, T., Kytölä, S., Mäkisalo, H., Färkkilä, M. & Arola, J., apr. 2024, I: Hepatology communications. 8, 14 s., e0415.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Patient-Specific Measurable Residual Disease Markers Predict Outcome in Patients With Myelodysplastic Syndrome and Related Diseases After Hematopoietic Stem-Cell Transplantation

Tobiasson, M., Pandzic, T., Illman, J., Nilsson, L., Weström, S., Ejerblad, E., Olesen, G., Björklund, A., Kittang, A. O., Werlenius, O., Lorentz, F., Rasmussen, B., Cammenga, J., Weber, D., Lindholm, C., Wiggh, J., Dimitriou, M., Moen, A. E., Yip Lundström, L. & Von Bahr, L. & 13 andra, Baltzer-Sollander, K., Jädersten, M., Kytölä, S., Walldin, G., Ljungman, P., Groenbaek, K., Mielke, S., Jacobsen, S. E. W., Ebeling, F., Cavelier, L., Smidstrup Friis, L., Dybedal, I. & Hellström-Lindberg, E., 20 apr. 2024, I: Journal of Clinical Oncology. 42, 12, s. 1378-1390 13 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

2023

Atypical (non-V600E) BRAF mutations in metastatic colorectal cancer in population and real-world cohorts

Osterlund, E., Ristimäki, A., Mäkinen, M. J., Kytölä, S., Kononen, J., Pfeiffer, P., Soveri, L.-M., Keinänen, M., Sorbye, H., Nunes, L., Salminen, T., Nieminen, L., Uutela, A., Halonen, P., Ålgars, A., Sundström, J., Kallio, R., Ristamäki, R., Lamminmäki, A. & Stedt, H. & 6 andra, Heervä, E., Kuopio, T., Sjöblom, T., Isoniemi, H., Glimelius, B. & Osterlund, P., 2023, I: International Journal of Cancer. 16 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Clonal dynamics using droplet digital polymerase chain reaction in peripheral blood predicts treatment responses in myelodysplastic syndrome

Illman, J., Kytölä, S., Myllymäki, M. & Ebeling, F., juli 2023, I: Haematologica. 108, 7, s. 1951-1956 6 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Brev › Vetenskaplig

Öppen tillgång

Fil

N-Glycomic Profiling of Microsatellite Unstable Colorectal Cancer

Ukkola, I., Nummela, P., Heiskanen, A., Holm, M., Zafar, S., Kero, M., Haglund, C., Satomaa, T., Kytola, S. & Ristimäki, A., juli 2023, I: Cancers. 15, 14, 17 s., 3571.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Sequential high-sensitivity mutational and chimerism analyses predict responses to post-transplant salvage therapies in MDS

Ebeling, F., Illman, J., Kankainen, M., Kontro, M., Partanen, A., Sahlstedt, L., Myllymäki, M., Niittyvuopio, R. & Kytölä, S., jan. 2023, I: Bone Marrow Transplantation. 58, 1, s. 100–102 3 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Brev › Vetenskaplig

2022

Circulating tumor DNA is a prognostic biomarker in metastatic melanoma patients treated with chemoimmunotherapy and BRAF inhibitor

Mattila, K. E., Makela, S., Kytölä, S., Andersson, E., Vihinen, P., Ramadan, S., Skyttä, T., Tiainen, L., Vuoristo, M.-S., Tyynela-Korhonen, K., Koivunen, J., Kohtamäki, L., Aittomäki, K. & Hernberg, M., 3 okt. 2022, I: Acta Oncologica. 61, 10, s. 1263-1267 5 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Epigenetic modifier gene mutations in chronic myeloid leukemia (CML) at diagnosis are associated with risk of relapse upon treatment discontinuation

Awad, S. A., Brück, O., Shanmuganathan, N., Järvinen, T., Lähteenmäki, H., Klievink, J., Ibrahim, H., Kytölä, S., Koskenvesa, P., Hughes, T. P., Branford, S., Kankainen, M. & Mustjoki, S., 20 apr. 2022, I: Blood cancer journal. 12, 4, 4 s., 69.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Brev › Vetenskaplig

Öppen tillgång

Fil

Gene fusions and oncogenic mutations in MLH1 deficient and BRAFV600E wild-type colorectal cancers

Ukkola, I., Nummela, P., Kero, M., Tammio, H., Tuominen, J., Kairisto, V., Kallajoki, M., Haglund, C., Peltomäki, P., Kytölä, S. & Ristimäki, A., apr. 2022, I: Virchows Archiv. 480, 4, s. 807-817 11 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

KRAS-G12C Mutation in One Real-Life and Three Population-Based Nordic Cohorts of Metastatic Colorectal Cancer

Osterlund, E., Ristimäki, A., Kytölä, S., Kuopio, T., Heervä, E., Muhonen, T., Halonen, P., Kallio, R., Soveri, L.-M., Sundström, J., Keinänen, M., Algars, A., Ristamäki, R., Sorbye, H., Pfeiffer, P., Nunes, L., Salminen, T., Lamminmäki, A., MÄkinen, M. J. & Sjöblom, T. & 3 andra, Isoniemi, H., Glimelius, B. & Österlund, P., 16 feb. 2022, I: Frontiers in oncology . 12, 11 s., 826073.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Resectability, conversion, metastasectomy and outcome according to RAS and BRAF status for metastatic colorectal cancer in the prospective RAXO study

Uutela, A., Osterlund, E., Halonen, P., Kallio, R., Ålgars, A., Salminen, T., Lamminmäki, A., Soveri, L.-M., Ristamäki, R., Lehtomäki, K., Stedt, H., Heervä, E., Muhonen, T., Kononen, J., Nordin, A., Ovissi, A., Kytölä, S., Keinänen, M., Sundström, J. & Nieminen, L. & 5 andra, Mäkinen, M. J., Kuopio, T., Ristimäki, A., Isoniemi, H. & Osterlund, P., 1 sep. 2022, I: British Journal of Cancer. 127, 4, s. 686-694 9 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Resectability and resection rates of colorectal liver metastases according to RAS and BRAF mutational status: prospective study

the RAXO Study Group, Uutela, A., Nordin, A., Osterlund, E., Halonen, P., Kallio, R., Soveri, L.-M., Salminen, T., Ålgars, A., Ristimaki, A., Ovissi, A., Lamminmaki, A., Muhonen, T., Kononen, J., Ristamäki, R., Heervä, E., Stedt, H., Lehtomäki, K., Kytolä, S. & Sundstrom, J. & 9 andra, Mäkinen, M. J., Nieminen, L., Kuopio, T., Keinanen, M., Osterlund, P., Isoniemi, H., Nyandoto, P., Aalto, A. & Lantto, E., 13 dec. 2022, I: British Journal of Surgery. 110, 8, s. 931–935 5 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Targeting Apoptosis Pathways With BCL2 and MDM2 Inhibitors in Adult B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia: s

Hohtari, H., Kankainen, M., Adnan-Awad, S., Yadav, B., Potdar, S., Ianevski, A., Dufva, O., Heckman, C., Sexl, V., Kytölä, S., Mustjoki, S. & Porkka, K., mars 2022, I: Hemasphere. 6, 3, 9 s., 701.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

2021

Altered linkage pattern of N-glycan sialic acids in pseudomyxoma peritonei

Nummela, P., Heiskanen, A., Kytölä, S., Haglund, C., Lepistö, A., Satomaa, T. & Ristimäki, A., mars 2021, I: Glycobiology. 31, 3, s. 211-222 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Characterization of p190-Bcr-Abl chronic myeloid leukemia reveals specific signaling pathways and therapeutic targets

Adnan-Awad, S., Hohtari, H., Kim, D., Javarappa, K. K., Brandstoetter, T., Mayer, I., Potdar, S., Heckman, C. A., Kytölä, S., Porkka, K., Doma, E., Sexl, V., Kankainen, M. & Mustjoki, S., juli 2021, I: Leukemia. 35, 7, s. 1964-1975 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Detection of microsatellite instability with Idylla MSI assay in colorectal and endometrial cancer

Ukkola, I., Nummela, P., Pasanen, A., Kero, M., Lepistö, A., Kytölä, S., Bützow, R. & Ristimäki, A., sep. 2021, I: Virchows Archiv. 479, 3, s. 471-479 9 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Machine Learning of Bone Marrow Histopathology Identifies Genetic and Clinical Determinants in Patients with MDS

Brück, O. E., Lallukka-Brück, S. E., Hohtari, H. R., Ianevski, A., Ebeling, F. T., Kovanen, P. E., Kytölä, S. I., Aittokallio, T. A., Ramos, P. M., Porkka, K. V. & Mustjoki, S. M., 1 maj 2021, I: Cancer Discovery. 2, 3, s. 238-249 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

2020

Detection of KRAS mutations in liquid biopsies from metastatic colorectal cancer patients using droplet digital PCR, Idylla, and next generation sequencing

Holm, M., Andersson, E., Osterlund, E., Ovissi, A., Soveri, L.-M., Anttonen, A.-K., Kytölä, S., Aittomäki, K., Osterlund, P. & Ristimäki, A., 25 nov. 2020, I: PLoS One. 15, 11, 13 s., 0239819.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Donor-Derived Cell-Free DNA as an Early Noninvasive Biomarker of Cardiac Allograft Injury and Rejection in Human Heart Transplant Recipients

Levä, E., Syrjälä, S., Kytölä, S., Kankainen, M., Krebs, R. & Lemström, K., 2020, I: Journal of Heart and Lung Transplantation. 39, 4, s. S302 1 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Mötesabstrakt › Peer review

IDH1 Expression via the R132H Mutation-Specific Antibody in Adrenocortical Neoplasias-Prognostic Impact in Carcinomas

Pennanen, M., Tynninen, O., Kytölä, S., Ellonen, P., Mustonen, H., Heiskanen, I., Haglund, C. & Arola, J., apr. 2020, I: Journal of the Endocrine Society. 4, 4, 10 s., 018.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Molekyylipatologia apuna haima-, sappitie- ja maksasyövän diagnostiikassa

Boyd, S., Rönty, M., Peltola, K., Seppänen, H., Kytölä, S., Ristimäki, A., Färkkilä, M. & Arola, J., 2020, I: Duodecim. 136, 23, s. 2675-2681 7 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

Mutation accumulation in cancer genes relates to nonoptimal outcome in chronic myeloid leukemia

Awad, S. A., Kankainen, M., Ojala, T., Koskenvesa, P., Eldfors, S., Ghimire, B., Kumar, A., Kytölä, S., Kamel, M. M., Heckman, C. A., Porkka, K. & Mustjoki, S., 11 feb. 2020, I: Blood advances. 4, 3, s. 546-559 14 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Pahanlaatuisuusaste ei yksin riitä - molekyylitutkimukset tarkentavat glioomien diagnostiikkaa

Tynninen, O., Paetau, A., Haapasalo, H. & Kytölä, S., 2020, I: Duodecim. 136, 10, s. 1202-1208 7 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Somatic mutations and T-cell clonality in patients with immunodeficiency

Savola, P., Martelius, T., Kankainen, M., Huuhtanen, J., Lundgren, S., Koski, Y., Eldfors, S., Kelkka, T., Keränen, M. A. I., Ellonen, P., Kovanen, P. E., Kytölä, S., Saarela, J., Lahdesmaki, H., Seppänen, M. R. J. & Mustjoki, S., dec. 2020, I: Haematologica. 105, 12, s. 2757-2768 12 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

2019

ERCC6L2 defines a novel entity within inherited acute myeloid leukemia

Douglas, S. P. M., Siipola, P., Kovanen, P. E., Pyörälä, M., Kakko, S., Savolainen, E.-R., Salmenniemi, U., Orte, K., Kytölä, S., Pitkänen, E., Porkka, K., Kilpivaara, O. & Wartiovaara-Kautto, U., 20 juni 2019, I: Blood. 133, 25, s. 2724-2728 7 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Brev › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Geenitieto muuttaa syöpäkirurgiaa, mutta ei ihan vielä

Juteau, S., Koljonen, V. & Kytölä, S., 2019, I: Duodecim. 135, 23, s. 2356 1 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Brev › Professionell

Öppen tillgång

Fil

MGMT Promoter Methylation and Parathyroid Carcinoma

Storvall, S., Ryhänen, E., Heiskanen, I., Vesterinen, T., Bensch, F. V., Schildt, J., Kytölä, S., Karhu, A., Arola, J. & Schalin-Jäntti, C., nov. 2019, I: Journal of the Endocrine Society. 3, 11, s. 2114–2122 9 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

2018

Discovery of novel drug sensitivities in T-PLL by high-throughput ex vivo drug testing and mutation profiling

Andersson, E. I., Pützer, S., Yadav, B., Dufva, O., Khan, S., He, L., Sellner, L., Schrader, A., Crispatzu, G., Oleś, M., Zhang, H., Adnan-Awad, S., Lagström, S., Bellanger, D., Mpindi, J. P., Eldfors, S., Pemovska, T., Pietarinen, P., Lauhio, A. & Tomska, K. & 19 andra, Cuesta-Mateos, C., Faber, E., Koschmieder, S., Brümmendorf, T. H., Kytölä, S., Savolainen, E.-R., Siitonen, T., Ellonen, P., Kallioniemi, O., Wennerberg, K., Ding, W., Stern, M.-H., Huber, W., Anders, S., Tang, J., Aittokallio, T., Zenz, T., Herling, M. & Mustjoki, S., mars 2018, I: Leukemia. 32, 3, s. 774-787 14 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review