Om du gjort några ändringar i Pure kommer de visas här snart.

Personlig profil

Utbildning / akademisk kvalifikation

Applied Mathematics, PhD, University of Turku

Externa befattningar

Professor of Statistics and Applied Mathematics, University of Turku

1 aug 2015 → …

Keywords

  • 3111 Biomedicinska vetenskaper
  • 111 Matematik
  • 113 Data- och informationsvetenskap
  • 112 Statistik

Internationellt och inhemskt samarbete Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.

Publikationer 2001 2019

Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

Menden, M. P., Wang, D., Mason, M. J., Szalai, B., Bulusu, K. C., Guan, Y., Yu, T., Kang, J., Jeon, M., Wolfinger, R., Nguyen, T., Zaslavskiy, M., Abante, J., Abecassis, B. S., Aben, N., Aghamirzaie, D., Aittokallio, T., Akhtari, F. S., Al-lazikani, B., Alam, T. & 280 andraAllam, A., Allen, C., de Almeida, M. P., Altarawy, D., Alves, V., Amadoz, A., Anchang, B., Antolin, A. A., Ash, J. R., Aznar, V. R., Ba-alawi, W., Bagheri, M., Bajic, V., Ball, G., Ballester, P. J., Baptista, D., Bare, C., Bateson, M., Bender, A., Bertrand, D., Wijayawardena, B., Boroevich, K. A., Bosdriesz, E., Bougouffa, S., Bounova, G., Brouwer, T., Bryant, B., Calaza, M., Calderone, A., Calza, S., Capuzzi, S., Carbonell-Caballero, J., Carlin, D., Carter, H., Castagnoli, L., Celebi, R., Cesareni, G., Chang, H., Chen, G., Chen, H., Chen, H., Cheng, L., Chernomoretz, A., Chicco, D., Cho, K-H., Cho, S., Choi, D., Choi, J., Choi, K., Choi, M., Cock, M. D., Coker, E., Cortes-Ciriano, I., Cserzö, M., Cubuk, C., Curtis, C., Daele, D. V., Dang, C. C., Dijkstra, T., Dopazo, J., Draghici, S., Drosou, A., Dumontier, M., Ehrhart, F., Eid, F-E., ElHefnawi, M., Elmarakeby, H., van Engelen, B., Engin, H. B., de Esch, I., Evelo, C., Falcao, A. O., Farag, S., Fernandez-Lozano, C., Fisch, K., Flobak, A., Fornari, C., Foroushani, A. B. K., Fotso, D. C., Fourches, D., Friend, S., Frigessi, A., Gao, F., Gao, X., Gerold, J. M., Gestraud, P., Ghosh, S., Gillberg, J., Godoy-Lorite, A., Godynyuk, L., Godzik, A., Goldenberg, A., Gomez-Cabrero, D., Gonen, M., de Graaf, C., Gray, H., Grechkin, M., Guimera, R., Guney, E., Haibe-Kains, B., Han, Y., Hase, T., He, D., He, L., Heath, L. S., Hellton, K. H., Helmer-Citterich, M., Hidalgo, M. R., Hidru, D., Hill, S. M., Hochreiter, S., Hong, S., Hovig, E., Hsueh, Y-C., Hu, Z., Huang, J. K., Huang, R. S., Hunyady, L., Hwang, J., Hwang, T. H., Hwang, W., Hwang, Y., Isayev, O., Don’t Walk, O. B., Jack, J., Jahandideh, S., Ji, J., Jo, Y., Kamola, P. J., Kanev, G. K., Karacosta, L., Karimi, M., Kaski, S., Kazanov, M., Khamis, A. M., Khan, S. A., Kiani, N. A., Kim, A., Kim, J., Kim, J., Kim, K., Kim, K., Kim, S., Kim, Y., Kim, Y., Kirk, P. D. W., Kitano, H., Klambauer, G., Knowles, D., Ko, M., Kohn-Luque, A., Kooistra, A. J., Kuenemann, M. A., Kuiper, M., Kurz, C., Kwon, M., van Laarhoven, T., Laegreid, A., Lederer, S., Lee, H., Lee, J., Lee, Y. W., Lepp_aho, E., Lewis, R., Li, J., Li, L., Liley, J., Lim, W. K., Lin, C., Liu, Y., Lopez, Y., Low, J., Lysenko, A., Machado, D., Madhukar, N., Maeyer, D. D., Malpartida, A. B., Mamitsuka, H., Marabita, F., Marchal, K., Marttinen, P., Mason, D., Mazaheri, A., Mehmood, A., Mehreen, A., Michaut, M., Miller, R. A., Mitsopoulos, C., Modos, D., Moerbeke, M. V., Moo, K., Motsinger-Reif, A., Movva, R., Muraru, S., Muratov, E., Mushthofa, M., Nagarajan, N., Nakken, S., Nath, A., Neuvial, P., Newton, R., Ning, Z., Niz, C. D., Oliva, B., Olsen, C., Palmeri, A., Panesar, B., Papadopoulos, S., Park, J., Park, S., Park, S., Pawitan, Y., Peluso, D., Pendyala, S., Peng, J., Perfetto, L., Pirro, S., Plevritis, S., Politi, R., Poon, H., Porta, E., Prellner, I., Preuer, K., Pujana, M. A., Ramnarine, R., Reid, J. E., Reyal, F., Richardson, S., Ricketts, C., Rieswijk, L., Rocha, M., Rodriguez-Gonzalvez, C., Roell, K., Rotroff, D., de Ruiter, J. R., Rukawa, P., Sadacca, B., Safikhani, Z., Safitri, F., Sales-Pardo, M., Sauer, S., Schlichting, M., Seoane, J. A., Serra, J., Shang, M-M., Sharma, A., Sharma, H., Shen, Y., Shiga, M., Shin, M., Shkedy, Z., Shopsowitz, K., Sinai, S., Skola, D., Smirnov, P., Soerensen, I. F., Soerensen, P., Song, J-H., Song, S. O., Soufan, O., Spitzmueller, A., Steipe, B., Suphavilai, C., Tamayo, S. P., Tamborero, D., Tang, J., Tanoli, Z-R., Tarres-Deulofeu, M., Tegner, J., Thommesen, L., Tonekaboni, S. A. M., Tran, H., Troyer, E. D., Truong, A., Tsunoda, T., Turu, G., Tzeng, G-Y., Verbeke, L., Videla, S. & Consortium, A-S. D. C. DREAM., 2019, I : Nature Communications. 10, 1

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

DNMT Inhibitors Increase Methylation in the Cancer Genome

Giri, A. K. & Aittokallio, T., 24 apr 2019, I : Frontiers in Pharmacology. 10, 11 s., 385.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Matrix and Tensor Factorization Methods for Toxicogenomic Modeling and Prediction

Khan, S. A., Aittokallio, T., Scherer, A., Grafström, R. & Kohonen, P., maj 2019, Advances in Computational Toxicology: Methodologies and Applications in Regulatory Science. Hong, H. (red.). Springer Nature Switzerland, s. 57-74 16 s. (Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics; vol. 30).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Network pharmacology modeling identifies synergistic Aurora B and ZAK interaction in triple-negative breast cancer

Tang, J., Gautam, P., Gupta, A., He, L., Timonen, S., Akimov, Y., Wang, W., Szwajda, A., Jaiswal, A., Turei, D., Yadav, B., Kankainen, M., Saarela, J., Saez-Rodriguez, J., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., 2019, I : npj Systems Biology and Applications. 5, 1

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Pharmacological reactivation of MYC-dependent apoptosis induces susceptibility to anti-PD-1 immunotherapy

Haikala, H. M., Anttila, J. M., Marques, E., Raatikainen, T., Ilander, M., Hakanen, H., Ala-Hongisto, H., Savelius, M., Balboa, D., Von Eyss, B., Eskelinen, V., Munne, P., Nieminen, A. I., Otonkoski, T., Schüler, J., Laajala, T. D., Aittokallio, T., Sihto, H., Mattson, J., Heikkilä, P. & 7 andraLeidenius, M., Joensuu, H., Mustjoki, S., Kovanen, P., Eilers, M., Leverson, J. D. & Klefström, J., 6 feb 2019, I : Nature Communications. 10, 17 s., 620.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Projekter 2011 2018

Priser

Helsinki Challenge

Jing Tang (!!Recipient), Samu Kurki (!!Recipient), Tero Aittokallio (!!Recipient), Emma I. Andersson (!!Recipient), Evgeny Kulesskiy (!!Recipient), Ashwini Kumar (!!Recipient), Dimitrios Tsallos (!!Recipient), Muntasir Majumder (!!Recipient), Olli Dufva (!!Recipient) & Mikko Keränen (!!Recipient), 22 nov 2017

Pris: Pris och hedersbetygelser

Aktiviteter 2011 2019

Computational analyses of small molecules activity from phenotypic screens

Tero Aittokallio (Handledare)
8 jan 2019

Aktivitet: ExaminationstyperFörhandsgranskare av doktorsavhandling

Machine Learning for Systems Pharmacology

Tero Aittokallio (Handledare)
5 okt 2018

Aktivitet: ExaminationstyperHandledare eller bihandledare av doktorsavhandling

University of Toronto

Tero Aittokallio (Besökande forskare)
28 feb 201826 apr 2018

Aktivitet: Typer för besök till extern institutionAkademisk besök på annan institution

Modeling and prediction of advanced prostate cancer

Tero Aittokallio (Handledare)
16 nov 2018

Aktivitet: ExaminationstyperHandledare eller bihandledare av doktorsavhandling

Bioinformatics analysis of intron retention events associated with the minor spliceosome

Tero Aittokallio (Handledare)
okt 2018

Aktivitet: ExaminationstyperFörhandsgranskare av doktorsavhandling