Tero Aittokallio

Personlig profil

Utbildning / akademisk kvalifikation

Applied Mathematics, PhD, University of Turku

Externa befattningar

Professor of Statistics and Applied Mathematics, University of Turku

1 aug 2015 → …

Keywords

3111 Biomedicinska vetenskaper
111 Matematik
113 Data- och informationsvetenskap
112 Statistik

Internationellt och inhemskt samarbete Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.

Publikationer 2001 2019

92 Artikel
8 Översiktsartikel
3 Mötesabstrakt
2 Kapitel
5 Mer

Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

Menden, M. P., Wang, D., Mason, M. J., Szalai, B., Bulusu, K. C., Guan, Y., Yu, T., Kang, J., Jeon, M., Wolfinger, R., Nguyen, T., Zaslavskiy, M., Abante, J., Abecassis, B. S., Aben, N., Aghamirzaie, D., Aittokallio, T., Akhtari, F. S., Al-lazikani, B., Alam, T. & 280 andraAllam, A., Allen, C., de Almeida, M. P., Altarawy, D., Alves, V., Amadoz, A., Anchang, B., Antolin, A. A., Ash, J. R., Aznar, V. R., Ba-alawi, W., Bagheri, M., Bajic, V., Ball, G., Ballester, P. J., Baptista, D., Bare, C., Bateson, M., Bender, A., Bertrand, D., Wijayawardena, B., Boroevich, K. A., Bosdriesz, E., Bougouffa, S., Bounova, G., Brouwer, T., Bryant, B., Calaza, M., Calderone, A., Calza, S., Capuzzi, S., Carbonell-Caballero, J., Carlin, D., Carter, H., Castagnoli, L., Celebi, R., Cesareni, G., Chang, H., Chen, G., Chen, H., Chen, H., Cheng, L., Chernomoretz, A., Chicco, D., Cho, K-H., Cho, S., Choi, D., Choi, J., Choi, K., Choi, M., Cock, M. D., Coker, E., Cortes-Ciriano, I., Cserzö, M., Cubuk, C., Curtis, C., Daele, D. V., Dang, C. C., Dijkstra, T., Dopazo, J., Draghici, S., Drosou, A., Dumontier, M., Ehrhart, F., Eid, F-E., ElHefnawi, M., Elmarakeby, H., van Engelen, B., Engin, H. B., de Esch, I., Evelo, C., Falcao, A. O., Farag, S., Fernandez-Lozano, C., Fisch, K., Flobak, A., Fornari, C., Foroushani, A. B. K., Fotso, D. C., Fourches, D., Friend, S., Frigessi, A., Gao, F., Gao, X., Gerold, J. M., Gestraud, P., Ghosh, S., Gillberg, J., Godoy-Lorite, A., Godynyuk, L., Godzik, A., Goldenberg, A., Gomez-Cabrero, D., Gonen, M., de Graaf, C., Gray, H., Grechkin, M., Guimera, R., Guney, E., Haibe-Kains, B., Han, Y., Hase, T., He, D., He, L., Heath, L. S., Hellton, K. H., Helmer-Citterich, M., Hidalgo, M. R., Hidru, D., Hill, S. M., Hochreiter, S., Hong, S., Hovig, E., Hsueh, Y-C., Hu, Z., Huang, J. K., Huang, R. S., Hunyady, L., Hwang, J., Hwang, T. H., Hwang, W., Hwang, Y., Isayev, O., Don’t Walk, O. B., Jack, J., Jahandideh, S., Ji, J., Jo, Y., Kamola, P. J., Kanev, G. K., Karacosta, L., Karimi, M., Kaski, S., Kazanov, M., Khamis, A. M., Khan, S. A., Kiani, N. A., Kim, A., Kim, J., Kim, J., Kim, K., Kim, K., Kim, S., Kim, Y., Kim, Y., Kirk, P. D. W., Kitano, H., Klambauer, G., Knowles, D., Ko, M., Kohn-Luque, A., Kooistra, A. J., Kuenemann, M. A., Kuiper, M., Kurz, C., Kwon, M., van Laarhoven, T., Laegreid, A., Lederer, S., Lee, H., Lee, J., Lee, Y. W., Lepp_aho, E., Lewis, R., Li, J., Li, L., Liley, J., Lim, W. K., Lin, C., Liu, Y., Lopez, Y., Low, J., Lysenko, A., Machado, D., Madhukar, N., Maeyer, D. D., Malpartida, A. B., Mamitsuka, H., Marabita, F., Marchal, K., Marttinen, P., Mason, D., Mazaheri, A., Mehmood, A., Mehreen, A., Michaut, M., Miller, R. A., Mitsopoulos, C., Modos, D., Moerbeke, M. V., Moo, K., Motsinger-Reif, A., Movva, R., Muraru, S., Muratov, E., Mushthofa, M., Nagarajan, N., Nakken, S., Nath, A., Neuvial, P., Newton, R., Ning, Z., Niz, C. D., Oliva, B., Olsen, C., Palmeri, A., Panesar, B., Papadopoulos, S., Park, J., Park, S., Park, S., Pawitan, Y., Peluso, D., Pendyala, S., Peng, J., Perfetto, L., Pirro, S., Plevritis, S., Politi, R., Poon, H., Porta, E., Prellner, I., Preuer, K., Pujana, M. A., Ramnarine, R., Reid, J. E., Reyal, F., Richardson, S., Ricketts, C., Rieswijk, L., Rocha, M., Rodriguez-Gonzalvez, C., Roell, K., Rotroff, D., de Ruiter, J. R., Rukawa, P., Sadacca, B., Safikhani, Z., Safitri, F., Sales-Pardo, M., Sauer, S., Schlichting, M., Seoane, J. A., Serra, J., Shang, M-M., Sharma, A., Sharma, H., Shen, Y., Shiga, M., Shin, M., Shkedy, Z., Shopsowitz, K., Sinai, S., Skola, D., Smirnov, P., Soerensen, I. F., Soerensen, P., Song, J-H., Song, S. O., Soufan, O., Spitzmueller, A., Steipe, B., Suphavilai, C., Tamayo, S. P., Tamborero, D., Tang, J., Tanoli, Z-R., Tarres-Deulofeu, M., Tegner, J., Thommesen, L., Tonekaboni, S. A. M., Tran, H., Troyer, E. D., Truong, A., Tsunoda, T., Turu, G., Tzeng, G-Y., Verbeke, L., Videla, S. & Consortium, A-S. D. C. DREAM., 2019, I : Nature Communications. 10, 1

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

DNMT Inhibitors Increase Methylation in the Cancer Genome

Giri, A. K. & Aittokallio, T., 24 apr 2019, I : Frontiers in Pharmacology. 10, 11 s., 385.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Matrix and Tensor Factorization Methods for Toxicogenomic Modeling and Prediction

Khan, S. A., Aittokallio, T., Scherer, A., Grafström, R. & Kohonen, P., maj 2019, Advances in Computational Toxicology: Methodologies and Applications in Regulatory Science. Hong, H. (red.). Springer Nature Switzerland, s. 57-74 16 s. (Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics; vol. 30).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig › Peer review

Network pharmacology modeling identifies synergistic Aurora B and ZAK interaction in triple-negative breast cancer

Tang, J., Gautam, P., Gupta, A., He, L., Timonen, S., Akimov, Y., Wang, W., Szwajda, A., Jaiswal, A., Turei, D., Yadav, B., Kankainen, M., Saarela, J., Saez-Rodriguez, J., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., 2019, I : npj Systems Biology and Applications. 5, 1

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Pharmacological reactivation of MYC-dependent apoptosis induces susceptibility to anti-PD-1 immunotherapy

Haikala, H. M., Anttila, J. M., Marques, E., Raatikainen, T., Ilander, M., Hakanen, H., Ala-Hongisto, H., Savelius, M., Balboa, D., Von Eyss, B., Eskelinen, V., Munne, P., Nieminen, A. I., Otonkoski, T., Schüler, J., Laajala, T. D., Aittokallio, T., Sihto, H., Mattson, J., Heikkilä, P. & 7 andraLeidenius, M., Joensuu, H., Mustjoki, S., Kovanen, P., Eilers, M., Leverson, J. D. & Klefström, J., 6 feb 2019, I : Nature Communications. 10, 17 s., 620.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Öppen tillgång

Fil

Projekter 2011 2018

1 Aktiv
13 Färdig

Elucidation of mechanisms of action of the natural stilbenoid pinosylvin via network pharmacology computational methods

Kibble, M. M., Aittokallio, T., Mäkelä, S., Saarinen, N. & Martinez Chacon , G.

01/01/2014 → …

Projekt: Forskningsprojekt

Predicting disease specific effects and mechanisms of action of compound combinations in phytotherapy

Kibble, M. M., Aittokallio, T., Tang, J., Sultan Khan, S. & Peddinti, G.

18/05/2015 → 18/12/2017

Projekt: Forskningsprojekt

Personalizing health and care - creating medically-driven integrative bioinformatics applications focused on oncology, CNS disorders and their comorbidities

Aittokallio, T. & Tang, J.

01/05/2015 → 30/04/2017

Projekt: Forskningsprojekt

Creating medically-driven integrative bioinformatics applications focused on oncology, CNS disorders and their comorbidities (MedBioinformatics)

Aittokallio, T.

European Commission / Horizon 2020

01/05/2015 → 30/04/2018

Projekt: Forskningsprojekt

Cancer society of Finland - Individualized drug target combinations: prediction, testing and translation

Tang, J., Aittokallio, T. & Wennerberg, K.

01/01/2015 → 31/12/2016

Projekt: Forskningsprojekt

Priser

Helsinki Challenge

Jing Tang (!!Recipient), Samu Kurki (!!Recipient), Tero Aittokallio (!!Recipient), Emma I. Andersson (!!Recipient), Evgeny Kulesskiy (!!Recipient), Ashwini Kumar (!!Recipient), Dimitrios Tsallos (!!Recipient), Muntasir Majumder (!!Recipient), Olli Dufva (!!Recipient) & Mikko Keränen (!!Recipient), 22 nov 2017

Pris: Pris och hedersbetygelser

Aktiviteter 2011 2019

7 Förhandsgranskare av doktorsavhandling
2 Handledare eller bihandledare av doktorsavhandling
1 Public Talks
1 Akademiskt besök på HU
2 Mer
- 1 Medlemskap eller annan roll i forskningsnätverk
- 1 Akademisk besök på annan institution