Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
Personlig profil
Information om forskning och undervisning
Tommi is a computer scientist/statistician at the Department of Computer Science. He develops algorithms and probabilistic models for analyzing DNA sequencing data from bacteria and does applied research on human pathogens on the WHO priority pathogen list.
Vetenskapsgrenar
- 112 Statistik
- 113 Data- och informationsvetenskap
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
-
A LONGITUDINAL GENOMIC AND FUNCTIONAL ANALYSIS OF CLOSTRIDIUM BOTULINUM ISOLATED FROM AN INFANT BOTULISM CASE
Douillard, F. P., Derman, Y., Woudstra, C., Selby, K., Mäklin, T., Honkela, A., Korkeala, H. & Lindstrom, M., jan. 2021, I: Toxicon. 190, s. S17-S17 1 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Mötesabstrakt › Forskning › Peer review
-
Bacterial Genomic Epidemiology with Mixed Samples
Mäklin, T., Kallonen, T., Alanko, J., Samuelsen, Ø., Hegstad, K., Mäkinen, V., Corander, J., Heinz, E. & Honkela, A., 15 nov. 2021, I: Microbial Genomics. 7, 11, 18 s., 000691.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Closing Clostridium botulinum Group III Genomes Using Long-Read Sequencing
Woudstra, C., Mäklin, T., Derman, Y., Bano, L., Skarin, H., Mazuet, C., Honkela, A. & Lindström, M., juni 2021, I: Microbiology Resource Announcements. 10, 22, 4 s., e01364-20.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
High-resolution sweep metagenomics using fast probabilistic inference
Mäklin, T., Kallonen, T., David, S., Boinett, C. J., Pascoe, B., Méric, G., Aanensen, D. M., Feil, E. J., Baker, S., Parkhill, J., Sheppard, S. K., Corander, J. & Honkela, A., 8 okt. 2021, I: Wellcome open research. 5, 14, 28 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Identifying Bacterial Strains from Sequencing Data
Mäklin, T., Corander, J. & Honkela, A., 2018, Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols. Mamitsuka, H. (red.). 2 red. New York, NY: Humana press, s. 1-7 7 s. (Methods in Molecular Biology; vol. 1807).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig › Peer review
Aktiviteter
-
University of Helsinki PhD Students (HYVÄT) (Extern organisation)
Tommi Mäklin (Styrelsemedlem)
1 jan. 2022 → …Aktivitet: Medlemskapstyper › Medlemskap eller annan roll i inhemskt/internationellt offentligt organ
-
Young researcher workshop
Tommi Mäklin (Närvarande)
14 juni 2022 → 15 juni 2022Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Helsingin yliopiston tieteentekijät ry - The Helsinki University Researchers and Teachers' Association HUART (Extern organisation)
Tommi Mäklin (Styrelsemedlem)
1 jan. 2022 → …Aktivitet: Medlemskapstyper › Medlemskap eller annan roll i inhemskt/internationellt offentligt organ
-
AMR and population genomics
Tommi Mäklin (Närvarande)
12 juni 2022 → 13 juni 2022Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
AMR-BRIDGE annual meeting
Tommi Mäklin (!!Invited speaker)
13 juni 2022 → 14 juni 2022Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Invited talk