Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
Personlig profil
Information om forskning och undervisning
Tommi is a computer scientist/statistician at the Department of Mathematics and Statistics. He develops algorithms and probabilistic models for analyzing DNA sequencing data from bacteria and does applied research on human pathogens on the WHO priority pathogen list.
Vetenskapsgrenar
- 112 Statistik
- 113 Data- och informationsvetenskap
- 11832 Mikrobiologi och virologi
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
-
Themisto: a scalable colored k-mer index for sensitive pseudoalignment against hundreds of thousands of bacterial genomes
Alanko, J. N., Vuohtoniemi, J., Mäklin, T. & Puglisi, S. J., 30 juni 2023, I: Bioinformatics. 39, Supplement 1, s. I260-I269 10 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Genomic and Phenotypic Characterization of Clostridium botulinum Isolates from an Infant Botulism Case Suggests Adaptation Signatures to the Gut
Douillard, F. P., Derman, Y., Woudstra, C., Selby, K., Mäklin, T., Dorner, M. B., Saxen, H., Dorner, B. G., Korkeala, H. & Lindström, M., 28 juni 2022, I: mBio. 13, 3, 13 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Probabilistic Methods for High-Resolution Metagenomics
Mäklin, T., 2022, Helsinki: Helsingin yliopisto.Forskningsoutput: Avhandling › Doktorsavhandling › Samling av artiklar
Öppen tillgång -
Strong pathogen competition in neonatal gut colonisation
Mäklin, T., Thorpe, H. A., Pöntinen, A. K., Gladstone, R. A., Shao, Y., Pesonen, M., McNally, A., Johnsen, P. J., Samuelsen, Ø., Lawley, T. D., Honkela, A. & Corander, J., 1 dec. 2022, I: Nature Communications. 13, 7417.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
A LONGITUDINAL GENOMIC AND FUNCTIONAL ANALYSIS OF CLOSTRIDIUM BOTULINUM ISOLATED FROM AN INFANT BOTULISM CASE
Douillard, F. P., Derman, Y., Woudstra, C., Selby, K., Mäklin, T., Honkela, A., Korkeala, H. & Lindstrom, M., jan. 2021, I: Toxicon. 190, s. S17-S17 1 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Mötesabstrakt › Peer review
Aktiviteter
-
Microbiome (Tidskrift)
Tommi Mäklin (Referentgranskare)
jan. 2023Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
EMBL European Bioinformatics Institute (EBI)
Tommi Mäklin (Besökande forskare)
1 feb. 2023 → 31 juli 2023Aktivitet: Typer för besök till extern institution › Akademisk besök på annan institution
-
Theory@EMBL Visitor fellowship
Tommi Mäklin (Pristagare)
feb. 2023Aktivitet: Andra aktivitetstyper › Pris och hedersbetygelser - Pris och hedersbetygelser
-
Scientific Reports (Tidskrift)
Tommi Mäklin (Referentgranskare)
mars 2023Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
Genome Biology (Tidskrift)
Tommi Mäklin (Referentgranskare)
sep. 2023Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
Tidningsurklipp
-
HS: Sairaalabakteeri ei tartu terveisiin vastasyntyneisiin, kertoo tutkimus
08/02/2023
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media