20142020

Forskningsoutput per år

Om du gjort några ändringar i Pure kommer de visas här snart.

Publikationer

2020

Anodal tDCS Over the Left Prefrontal Cortex Does Not Cause Clinically Significant Changes in Circulating Metabolites

Kortteenniemi, A., Ortega-Alonso, A., Javadi, A-H., Tolmunen, T., Ali-Sisto, T., Kotilainen, T., Wikgren, J., Karhunen, L., Velagapudi, V. & Lehto, S. M., 7 maj 2020, I : Frontiers in psychiatry. 11, 11 s., 403.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2019

Biobanking for Metabolomics and Lipidomics in Precision Medicine

Kirwan, J. A., Kaddurah-Daouk, R., Mitchell, T., Pischon, T., Schmidt, M. A. & Velagapudi, V., jul 2019, I : Clinical Chemistry (Washington, DC). 65, 7, s. 827-832 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragLedareVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Changes in the serum metabolite profile correlate with decreased brain gray matter volume in moderate-to-heavy drinking young adults

Heikkinen, N., Kärkkäinen, O., Laukkanen, E., Kekkonen, V., Kaarre, O., Kivimäki, P., Könönen, M., Velagapudi, V., Nandania, J., Lehto, S. M., Niskanen, E., Vanninen, R. & Tolmunen, T., mar 2019, I : Alcohol (New York). 75, s. 89-97 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Disruption of the mouse Shmt2 gene confers embryonic anaemia via foetal liver-specific metabolomic disorders

Tani, H., Mito, T., Velagapudi, V., Ishikawa, K., Umehara, M., Nakada, K., Suomalainen, A. & Hayashi, J-I., 5 nov 2019, I : Scientific Reports. 9, 11 s., 16054.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Epigenome-wide association study of serum cotinine in current smokers reveals novel genetically driven loci

Gupta, R., van Dongen, J., Fu, Y., Abdellaoui, A., Tyndale, R. F., Velagapudi, V., Boomsma, D. I., Korhonen, T., Kaprio, J., Loukola, A. & Ollikainen, M., 5 jan 2019, I : Clinical epigenetics. 11, 13 s., 1.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Fibroblast Growth Factor 21 Drives Dynamics of Local and Systemic Stress Responses in Mitochondrial Myopathy with mtDNA Deletions

Forsström, S., Jackson, C. B., Carroll, C. J., Kuronen, M., Pirinen, E., Pradhan, S., Marmyleva, A., Auranen, M., Kleine, I-M., Khan, N. A., Roivainen, A., Marjamäki, P., Liljenbäck, H., Wang, L., Battersby, B. J., Richter, U., Velagapudi, V., Nikkanen, J., Euro, L. & Suomalainen, A., 3 dec 2019, I : Cell Metabolism. 30, 6, s. 1040-+ 22 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Integrated targeted metabolomic and lipidomic analysis: A novel approach to classifying early cystic precursors to invasive pancreatic cancer

Gaiser, R. A., Pessia, A., Ateeb, Z., Davanian, H., Fernández Moro, C., Alkharaan, H., Healy, K., Ghazi, S., Arnelo, U., Valente, R., Velagapudi, V., Sällberg Chen, M. & Del Chiaro, M., 15 jul 2019, I : Scientific Reports. 9, 12 s., 10208.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Repeated Transcranial Magnetic Stimulation-Induced Motor Evoked Potentials Correlate With the Subject-Specific Serum Metabolic Profile of Creatine

Kallioniemi, E., Kärkkäinen, O., Määttä, S., Kononen, M., Kivimaki, P., Kaarre, O., Velagapudi, V., Kekkonen, V., Lehto, S. M., Laukkanen, E. & Tolmunen, T., maj 2019, I : Journal of Clinical Neurophysiology. 36, 3, s. 229-235 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2018

Adipose tissue mitochondrial capacity associates with long-term weight loss success

Jokinen, R., Rinnankoski-Tuikka, R., Kaye, S., Saarinen, L., Heinonen, S., Myöhänen, M., Rappou, E., Jukarainen, S., Rissanen, A., Pessia, A., Velagapudi, V., Virtanen, K. A., Pirinen, E. & Pietiläinen, K. H., apr 2018, I : International Journal of Obesity. 42, 4, s. 817-825 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

A Systems Approach to Study Immuno- and Neuro-Modulatory Properties of Antiviral Agents

Zusinaite, E., Ianevski, A., Niukkanen, D., Poranen, M. M., Bjoras, M., Afset, J. E., Tenson, T., Velagapudi, V., Merits, A. & Kainov, D. E., aug 2018, I : Viruses. 10, 8, 13 s., 423.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Global arginine bioavailability ratio is decreased in patients with major depressive disorder

Ali-Sisto, T., Tolmunen, T., Viinamäki, H., Mäntyselkä, P., Valkonen-Korhonen, M., Koivumaa-Honkanen, H., Honkalampi, K., Ruusunen, A., Nandania, J., Velagapudi, V. & Lehto, S. M., 15 mar 2018, I : Journal of Affective Disorders. 229, s. 145-151 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Metabolomes of mitochondrial diseases and inclusion body myositis patients: treatment targets and biomarkers

Buzkova, J., Nikkanen, J., Ahola, S., Hakonen, A. H., Sevastianova, K., Hovinen, T., Yki-Järvinen, H., Pietiläinen, K. H., Lönnqvist, T., Velagapudi, V., Carroll, C. J. & Suomalainen, A., dec 2018, I : EMBO molecular medicine. 10, 12, 15 s., 9091.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Preanalytical Processing and Biobanking Procedures of Biological Samples for Metabolomics Research: A White Paper, Community Perspective (for "Precision Medicine and Pharmacometabolomics Task Group"-The Metabolomics Society Initiative)

Kirwan, J. A., Brennan, L., Broadhurst, D., Fiehn, O., Cascante, M., Dunn, W. B., Schmidt, M. A. & Velagapudi, V., aug 2018, I : Clinical Chemistry (Washington, DC). 64, 8, s. 1158-1182 25 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Simultaneous measurement of folate cycle intermediates in different biological matrices using liquid chromatography-tandem mass spectrometry

Nandania, J., Kokkonen, M., Euro, L. & Velagapudi, V., 15 aug 2018, I : Journal of Chromatography. B. 1092, s. 168-178 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Understanding the metabolic burden of recombinant antibody production in Saccharomyces cerevisiae using a quantitative metabolomics approach

de Ruijter, J. C., Koskela, E. V., Nandania, J., Frey, A. D. & Velagapudi, V., apr 2018, I : Yeast : a forum for yeast researchers. 35, 4, s. 331-341 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Validation and Automation of a High-Throughput Multitargeted Method for Semiquantification of Endogenous Metabolites from Different Biological Matrices Using Tandem Mass Spectrometry

Nandania, J., Peddinti, G., Pessia, A., Kokkonen, M. & Velagapudi, V., sep 2018, I : Metabolites. 8, 3, 22 s., 44.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2017

Antiviral Properties of Chemical Inhibitors of Cellular Anti-Apoptotic Bcl-2 Proteins

Bulanova, D., Ianevski, A., Bugai, A., Akimov, Y., Kuivanen, S., Paavilainen, H., Kakkola, L., Nandania, J., Turunen, L., Ohman, T., Ala-Hongisto, H., Pesonen, H. M., Kuisma, M. S., Honkimaa, A., Walton, E. L., Oksenych, V., Lorey, M. B., Guschin, D., Shim, J., Kim, J. & 23 andra, Than, T. T., Chang, S. Y., Hukkanen, V., Kulesskiy, E., Marjomaki, V. S., Julkunen, I., Nyman, T. A., Matikainen, S., Saarela, J. S., Sane, F., Hober, D., Gabriel, G., De Brabander, J. K., Martikainen, M., Windisch, M. P., Min, J-Y., Bruzzone, R., Aittokallio, T., Vaha-Koskela, M., Vapalahti, O., Pulk, A., Velagapudi, V. & Kainov, D. E., okt 2017, I : Viruses. 9, 10, 15 s., 271.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Broad AOX expression in a genetically tractable mouse model does not disturb normal physiology

Szibor, M., Dhandapani, P. K., Dufour, E., Holmstrom, K. M., Zhuang, Y., Salwig, I., Wittig, I., Heidler, J., Gizatullina, Z., Gainutdinov, T., Fuchs, H., Gailus-Durner, V., de Angelis, M. H., Nandania, J., Velagapudi, V., Wietelmann, A., Rustin, P., Gellerich, F. N., Jacobs, H. T., Braun, T. & 1 andra, German Mouse Clinic Consortium, 1 feb 2017, I : Disease Models & Mechanisms. 10, 2, s. 163-171 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

CLUH regulates mitochondrial metabolism by controlling translation and decay of target mRNAs

Schatton, D., Pla-Martin, D., Marx, M-C., Hansen, H., Mourier, A., Nemazanyy, I., Pessia, A., Zentis, P., Corona, T., Kondylis, V., Barth, E., Schauss, A. C., Velagapudi, V. & Rugarli, E. I., 6 mar 2017, I : Journal of Cell Biology. 216, 3, s. 675-693 19 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Combined immunodeficiency and hypoglycemia associated with mutations in hypoxia upregulated 1

Haapaniemi, E. M., Fogarty, C., Keskitalo, S., Katayama, S., Vihinen, H., Ilander, M., Mustjoki, S., Krjutskov, K., Lehto, M., Hautala, T., Eriksson-Rosenberg, O., Jokitalo, E., Velagapudi, V., Varjosalo, M., Seppanen, M. & Kere, J., apr 2017, I : Journal of Allergy and Clinical Immunology. 139, 4, s. 1391-+ 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

Öppen tillgång
Fil

Endogenous and xenobiotic metabolic stability of primary human hepatocytes in long-term 3D spheroid cultures revealed by a combination of targeted and untargeted metabolomics

Vorrink, S. U., Ullah, S., Schmidt, S., Nandania, J., Velagapudi, V., Beck, O., Ingelman-Sundberg, M. & Lauschke, V. M., jun 2017, I : FASEB Journal. 31, 6, s. 2696-2708 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Faecal and serum metabolomics in paediatric inflammatory bowel disease

Kolho, K-L., Pessia, A., Jaakkola, T., de Vos, W. M. & Velagapudi, V., 1 mar 2017, I : Journal of Crohn's and Colitis. 11, 3, s. 321-334 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Host-Microbe Co-metabolism Dictates Cancer Drug Efficacy in C. elegans

Scott, T. A., Quintaneiro, L. M., Norvaisas, P., Lui, P. P., Wilson, M. P., Leung, K-Y., Herrera-Dominguez, L., Sudiwala, S., Pessia, A., Clayton, P. T., Bryson, K., Velagapudi, V., Mills, P. B., Typas, A., Greene, N. D. E. & Cabreiro, F., 20 apr 2017, I : Cell. 169, 3, s. 442-+ 33 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Hypothalamic AMPK-ER Stress-JNK1 Axis Mediates the Central Actions of Thyroid Hormones on Energy Balance

Martinez-Sanchez, N., Seoane-Collazo, P., Contreras, C., Varela, L., Villarroya, J., Rial-Pensado, E., Buque, X., Aurrekoetxea, I., Delgado, T. C., Vazquez-Martinez, R., Gonzalez-Garcia, I., Roa, J., Whittle, A. J., Gomez-Santos, B., Velagapudi, V., Loraine Tung, Y. C., Morgan, D. A., Voshol, P. J., Martinez de Morentin, P. B., Lopez-Gonzalez, T. & 21 andra, Linares-Pose, L., Gonzalez, F., Chatterjee, K., Sobrino, T., Medina-Gomez, G., Davis, R. J., Casals, N., Oresic, M., Coll, A. P., Vidal-Puig, A., Mittag, J., Tena-Sempere, M., Malagon, M. M., Dieguez, C., Martinez-Chantar, M. L., Aspichueta, P., Rahmouni, K., Nogueiras, R., Sabio, G., Villarroya, F. & Lopez, M., 5 jul 2017, I : Cell Metabolism. 26, 1, s. 212-+ 30 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Ketogenic diet attenuates hepatopathy in mouse model of respiratory chain complex III deficiency caused by a Bcs1l mutation

Purhonen, J., Rajendran, J., Morgelin, M., Uusi-Rauva, K., Katayama, S., Krjutskov, K., Einarsdottir, E., Velagapudi, V., Kere, J., Jauhiainen, M., Fellman, V. & Kallijarvi, J., 19 apr 2017, I : Scientific Reports. 7, 16 s., 957.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
Öppen tillgång
Fil

mTORC1 Regulates Mitochondrial Integrated Stress Response and Mitochondrial Myopathy Progression

Khan, N., Nikkanen, J., Yatsuga, S., Jackson, C., Wang, L., Pradhan, S., Kivelä, R., Pessia, A., Velagapudi, V. & Suomalainen, A., 1 aug 2017, I : Cell Metabolism. 26, 2, s. 419–428 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Regulation of kynurenine biosynthesis during influenza virus infection

Gaelings, L., Söderholm, S. L., Bugai, A., Fu, Y., Nandania, J., Schepens, B., Lorey, M. B., Tynell, J., Marjomäki, V., Matikainen, S., Nyman, T. A., Saelens, X., Julkunen, I., Velagapudi, V. & Kainov, D., jan 2017, I : The FEBS Journal. 284, 2, s. 222-236 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

The Association Between Musculoskeletal Pain and Circulating Ornithine: A Population-Based Study

Mantyselka, P., Ali-Sisto, T., Kautiainen, H., Niskanen, L., Viinamaki, H., Velagapudi, V. & Lehto, S. M., jun 2017, I : Pain Medicine. 18, 6, s. 1145-1151 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
2016

Activation of Tryptophan and Phenylalanine Catabolism in the Remission Phase of Allergic Contact Dermatitis: A Pilot Study

Zinkevitiene, A., Kainov, D., Girkontaite, I., Lastauskiene, E., Kvedariene, V., Fu, Y., Anders, S. & Velagapudi, V., 2016, I : International Archives of Allergy and Immunology. 170, 4, s. 262-268 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Effect of High-Carbohydrate Diet on Plasma Metabolome in Mice with Mitochondrial Respiratory Chain Complex III Deficiency

Rajendran, J., Tomasic, N., Kotarsky, H., Hansson, E., Velagapudi, V., Kallijarvi, J. & Fellman, V., nov 2016, I : International Journal of Molecular Sciences. 17, 11, 13 s., 1824.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

GATA4 Regulates Blood-Testis Barrier Function and Lactate Metabolism in Mouse Sertoli Cells

Schrade, A., Kyronlahti, A., Akinrinade, O., Pihlajoki, M., Fischer, S., Rodriguez, V. M., Otte, K., Velagapudi, V., Toppari, J., Wilson, D. B. & Heikinheimo, M., jun 2016, I : Endocrinology. 157, 6, s. 2416-2431 16 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

JNJ872 inhibits influenza A virus replication without altering cellular antiviral responses

Fu, Y., Gaelings, L., Soderholm, S., Belanov, S., Nandania, J., Nyman, T. A., Matikainen, S., Anders, S., Velagapudi, V. & Kainov, D. E., sep 2016, I : Antiviral Research. 133, s. 23-31 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Mitochondrial DNA Replication Defects Disturb Cellular dNTP Pools and Remodel One-Carbon Metabolism

Nikkanen, J., Forsstrom, S., Euro, L., Paetau, I., Kohnz, R. A., Wang, L., Chilov, D., Viinamaki, J., Roivainen, A., Marjamaki, P., Liljenback, H., Ahola, S., Buzkova, J., Terzioglu, M., Khan, N. A., Pirnes-Karhu, S., Paetau, A., Lonnqvist, T., Sajantila, A., Isohanni, P. & 6 andra, Tyynismaa, H., Nomura, D. K., Battersby, B. J., Velagapudi, V., Carroll, C. J. & Suomalainen, A., 12 apr 2016, I : Cell Metabolism. 23, 4, s. 635-648 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Modified Atkins diet induces subacute selective ragged-red-fiber lysis in mitochondrial myopathypatients

Ahola, S., Auranen, M., Isohanni, P., Niemisalo, S., Urho, N., Buzkova, J., Velagapudi, V., Lundbom, N., Hakkarainen, A., Muurinen, T., Piirilä, P., Pietilainen, K. H. & Suomalainen, A., nov 2016, I : EMBO molecular medicine. 8, 11, s. 1234-1247 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Purine metabolism is dysregulated in patients with major depressive disorder

Ali-Sisto, T., Tolmunen, T., Toffol, E., Viinamaki, H., Mantyselka, P., Valkonen-Korhonen, M., Honkalampi, K., Ruusunen, A., Velagapudi, V. & Lehto, S. M., 1 aug 2016, I : Psychoneuroendocrinology. 70, s. 25-32 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The Pentose Phosphate Pathway Regulates the Circadian Clock

Rey, G., Valekunja, U. K., Feeney, K. A., Wulund, L., Milev, N. B., Stangherlin, A., Ansel-Bollepalli, L., Velagapudi, V., O'Neill, J. S. & Reddy, A. B., 13 sep 2016, I : Cell Metabolism. 24, 3, s. 462-473 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2015

GATA4 Is a Key Regulator of Steroidogenesis and Glycolysis in Mouse Leydig Cells

Schrade, A., Kyronlahti, A., Akinrinade, O., Pihlajoki, M., Hakkinen, M., Fischer, S., Alastalo, T-P., Velagapudi, V., Toppari, J., Wilson, D. B. & Heikinheimo, M., maj 2015, I : Endocrinology. 156, 5, s. 1860-1872 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Roux-en-Y Gastric Bypass Surgery Induces Early Plasma Metabolomic and Lipidomic Alterations in Humans Associated with Diabetes Remission

Arora, T., Velagapudi, V., Pournaras, D. J., Welbourn, R., le Roux, C. W., Oresic, M. & Backhed, F., 6 maj 2015, I : PLoS One. 10, 5, 10 s., 0126401.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2014

Effective treatment of mitochondrial myopathy by nicotinamide riboside, a vitamin B3

Khan, N. A., Auranen, M., Paetau, I., Pirinen, E., Euro, L., Forsström, S., Pasila, L., Velagapudi, V., Carroll, C. J., Auwerx, J. & Suomalainen, A., jun 2014, I : EMBO molecular medicine. 6, 6, s. 721-731 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Vitamin B-12-dependent taurine synthesis regulates growth and bone mass

Roman-Garcia, P., Quiros-Gonzalez, I., Mottram, L., Lieben, L., Sharan, K., Wangwiwatsin, A., Tubio, J., Lewis, K., Wilkinson, D., Santhanam, B., Sarper, N., Clare, S., Vassiliou, G. S., Velagapudi, V. R., Dougan, G. & Yadav, V. K., jul 2014, I : Journal of Clinical Investigation. 124, 7, s. 2988-3002 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review