Foto på Willem Meindert Vos de

Willem Meindert Vos de

19992019
Om du gjort några ändringar i Pure kommer de visas här snart.

Publikationer 1999 2019

2017

Critically ill patients demonstrate large interpersonal variation in intestinal microbiota dysregulation: a pilot study

Lankelma, J. M., van Vught, L. A., Belzer, C., Schultz, M. J., van der Poll, T., de Vos, W. M. & Wiersinga, W. J., jan 2017, I : Intensive Care Medicine. 43, 1, s. 59-68 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Distinct fecal and oral microbiota composition in human type 1 diabetes, an observational study

de Groot, P. F., Belzer, C., Aydin, O., Levin, E., Levels, J. H., Aalvink, S., Boot, F., Holleman, F., van Raalte, D. H., Scheithauer, T. P., Simsek, S., Schaap, F. G., Damink, S. W. M. O., Roep, B. O., Hoekstra, J. B., de Vos, W. M. & Nieuwdorp, M., 6 dec 2017, I : PLoS One. 12, 12, 14 s., 0188475.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Draft genome sequences of the aerobic strains Lactobacillus gasseri AL3 and AL5

Maresca, D., De Filippis, F., Tytgat, H. L. P., de Vos, W. M. & Maurielloa, G., 2017, I : Genome Announcements. 5, 18, 2 s., e00213-17.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Effects of plant stanol ester consumption on fasting plasma oxy(phyto) sterol concentrations as related to fecal microbiota characteristics

Baumgartner, S., Mensink, R. P., De Smet, E., Konings, M., Fuentes, S., de Vos, W. M. & Plat, J., maj 2017, I : Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 169, s. 46-53 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Encapsulation of the therapeutic microbe Akkermansia muciniphila in a double emulsion enhances survival in simulated gastric conditions

van der Ark, K. C. H., Nugroho, A. D. W., Berton-Carabin, C., Wang, C., Belzer, C., de Vos, W. M. & Schroen, K., dec 2017, I : Food Research International. 102, s. 372-379 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Enrichment of sulfidogenic bacteria from the human intestinal tract

Feng, Y., Stams, A. J. M., de Vos, W. M. & Sanchez-Andrea, I., 2017, I : FEMS Microbiology Letters. 364, 4, 7 s., 028.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

European consensus conference on faecal microbiota transplantation in clinical practice

Cammarota, G., Ianiro, G., Tilg, H., Rajilic-Stojanovic, M., Kump, P., Satokari, R., Sokol, H., Arkkila, P., Pintus, C., Hart, A., Segal, J., Aloi, M., Masucci, L., Molinaro, A., Scaldaferri, F., Gasbarrini, G., Lopez-Sanroman, A., Link, A., De Groot, P., de Vos, W. M. & 9 andraHoegenauer, C., Malfertheiner, P., Mattila, E., Milosavljevic, T., Nieuwdorp, M., Sanguinetti, M., Simren, M., Gasbarrini, A. & European FMT Working Grp, apr 2017, I : Gut. 66, 4, s. 569-580 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Faecal and serum metabolomics in paediatric inflammatory bowel disease

Kolho, K-L., Pessia, A., Jaakkola, T., de Vos, W. M. & Velagapudi, V., 1 mar 2017, I : Journal of Crohn's and Colitis. 11, 3, s. 321-334 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Feasibility of Metatranscriptome Analysis from Infant Gut Microbiota: Adaptation to Solid Foods Results in Increased Activity of Firmicutes at Six Months

Hugenholtz, F., Ritari, J., Nylund, L., Davids, M., Satokari, R. & Vos, W. M. D., 2017, I : International Journal of Microbiology. 2017, 9 s., 9547063.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Genome-Scale Model and Omics Analysis of Metabolic Capacities of Akkermansia muciniphila Reveal a Preferential Mucin-Degrading Lifestyle

Ottman, N., Davids, M., Suarez-Diez, M., Boeren, S., Schaap, P. J., dos Santos, V. A. P. M., Smidt, H., Belzer, C. & de Vos, W. M., sep 2017, I : Applied and Environmental Microbiology. 83, 18, 15 s., 01014.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Genomic and functional analysis of Romboutsia ilealis CRIBT reveals adaptation to the small intestine

Gerritsen, J., Hornung, B., Renckens, B., van Hijum, S. A. F. T., dos Santos, V. A. P. M., Rijkers, G. T., Schaap, P. J., de Vos, W. M. & Smidt, H., 11 sep 2017, I : PeerJ. 5, 28 s., 3698.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Genotypic and phenotypic diversity of Lactobacillus rhamnosus clinical isolates, their comparison with strain GG and their recognition by complement system

Nissila, E., Douillard, F. P., Ritari, J., Paulin, L., Jarvinen, H. M., Rasinkangas, P., Haapasalo, K., Meri, S., Jarva, H. & de Vos, W. M., 11 maj 2017, I : PLoS One. 12, 5, 18 s., 0176739.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Gut health and the personal microbiome

Kolmeder, C. A. & de Vos, W. M., 2017, Nutrigenomics and proteomics in health and disease : towards a systems-level understanding of gene-diet interactions . Kussmann, M. & Stover, P. J. (red.). 2nd ed. red. Chichester, West Sussex : Wiley Blackwell, s. 203-219 17 s. (Functional food science and technology series).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Improvement of Insulin Sensitivity after Lean Donor Feces in Metabolic Syndrome Is Driven by Baseline Intestinal Microbiota Composition

Kootte, R. S., Levin, E., Salojarvi, J., Smits, L. P., Hartstra, A. V., Udayappan, S. D., Hermes, G., Bouter, K. E., Koopen, A. M., Holst, J. J., Knop, F. K., Blaak, E. E., Zhao, J., Smidt, H., Harms, A. C., Hankemeijer, T., Bergman, J. J. G. H. M., Romijn, H. A., Schaap, F. G., Damink, S. W. M. O. & 8 andraAckermans, M. T., Dallinga-Thie, G. M., Zoetendal, E., de Vos, W. M., Serlie, M. J., Stroes, E. S. G., Groen, A. K. & Nieuwdorp, M., 3 okt 2017, I : Cell Metabolism. 26, 4, s. 611-+ 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Intestinal microbiome landscaping: insight in community assemblage and implications for microbial modulation strategies

Shetty, S. A., Hugenholtz, F., Lahti, L., Smidt, H. & de Vos, W. M., mar 2017, I : FEMS Microbiology Reviews. 41, 2, s. 182-199 18 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Intestinal Ralstonia pickettii augments glucose intolerance in obesity

Udayappan, S. D., Kovatcheva-Datchary, P., Bakker, G. J., Havik, S. R., Herrema, H., Cani, P. D., Bouter, K. E., Belzer, C., Witjes, J. J., Vrieze, A., de Sonnaville, N., Chaplin, A., van Raalte, D. H., Aalvink, S., Dallinga-Thie, G. M., Heilig, H. G. H. J., Bergstrom, G., van der Meij, S., van Wagensveld, B. A., Hoekstra, J. B. L. & 6 andraHolleman, F., Stroes, E. S. G., Groen, A. K., Backhed, F., de Vos, W. M. & Nieuwdorp, M., 22 nov 2017, I : PLoS One. 12, 11, 15 s., 0181693.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Microbe Profile: Akkermansia muciniphila: a conserved intestinal symbiont that acts as the gatekeeper of our mucosa

de Vos, W. M., maj 2017, I : Microbiology. 163, 5, s. 646-648 3 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Microbial Metabolic Networks at the Mucus Layer Lead to Diet-Independent Butyrate and Vitamin B12 Production by Intestinal Symbionts

Belzer, C., Chia, L. W., Aalvink, S., Chamlagain, B., Piironen, V., Knol, J. & de Vos, W. M., 19 sep 2017, I : mBio. 8, 5, 14 s., ARTN e00770-17.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Microbial shifts and signatures of long-term remission in ulcerative colitis after faecal microbiota transplantation

Fuentes, S., Rossen, N. G., van der Spek, M. J., Hartman, J. H. A., Huuskonen, L., Korpela, K., Salojarvi, J., Aalvink, S., de Vos, W. M., D'Haens, G. R., Zoetendal, E. G. & Ponsioen, C. Y., aug 2017, I : ISME Journal. 11, 8, s. 1877-1889 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Microbiome yarns: microbiomology of curly and straight hair

Timmis, K., Jebok, F., Rigat, F., de Vos, W. M. & Timmis, J. K., mar 2017, I : Microbial Biotechnology. 10, 2, s. 231-237 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

Öppen tillgång
Fil

More than just a gut feeling: constraint-based genome-scale metabolic models for predicting functions of human intestinal microbes

van der Ark, K. C. H., van Heck, R. G. A., Dos Santos, V. A. P. M., Belzer, C. & de Vos, W. M., 14 jul 2017, I : Microbiome. 5, 13 s., 78.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Next-Generation Beneficial Microbes: The Case of Akkermansia muciniphila

Cani, P. D. & de Vos, W. M., 22 sep 2017, I : Frontiers in Microbiology. 8, 8 s., 1765.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Pili-like proteins of Akkermansia muciniphila modulate host immune responses and gut barrier function

Ottman, N., Reunanen, J., Meijerink, M., Pietilä, T., Kainulainen, V., Klievink, J., Huuskonen, L., Aalvink, S., Skurnik, M., Boeren, S., Satokari, R., Mercenier, A., Palva, A., Smidt, H., de Vos, W. M. & Belzer, C., 1 mar 2017, I : PLoS One. 12, 3, 18 s., 0173004.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Preparation and preservation of viable Akkermansia muciniphila cells for therapeutic interventions

Ouwerkerk, J. P., Aalvink, S., Belzer, C. & De Vos, W. M., 2017, I : Beneficial Microbes. 8, 2, s. 163-169 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Safety of Novel Microbes for Human Consumption: Practical Examples of Assessment in the European Union

Brodmann, T., Endo, A., Gueimonde, M., Vinderola, G., Kneifel, W., de Vos, W. M., Salminen, S. & Gomez-Gallego, C., 12 sep 2017, I : Frontiers in Microbiology. 8, 15 s., 1725.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Significant Correlation Between the Infant Gut Microbiome and Rotavirus Vaccine Response in Rural Ghana

Harris, V. C., Armah, G., Fuentes, S., Korpela, K. E., Parashar, U., Victor, J. C., Tate, J., de Weerth, C., Giaquinto, C., Wiersinga, W. J., Lewis, K. D. C. & de Vos, W. M., 1 jan 2017, I : Journal of Infectious Diseases. 215, 1, s. 34-41 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Streptococcus caviae sp nov., isolated from guinea pig faecal samples

Ayudthaya, S. P. N., Hilderink, L. J., van der Oost, J., de Vos, W. M. & Plugge, C. M., maj 2017, I : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 67, 5, s. 1551-1556 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

The contribution of microbial biotechnology to sustainable development goals

Timmis, K., de Vos, W. M., Luis Ramos, J., Vlaeminck, S. E., Prieto, A., Danchin, A., Verstraete, W., de Lorenzo, V., Lee, S. Y., Brussow, H., Timmis, J. K. & Singh, B. K., sep 2017, I : Microbial Biotechnology. 10, 5, s. 984-987 4 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

Öppen tillgång
Fil

The First Microbial Colonizers of the Human Gut: Composition, Activities, and Health Implications of the Infant Gut Microbiota

Milani, C., Duranti, S., Bottacini, F., Casey, E., Turroni, F., Mahony, J., Belzer, C., Delgado Palacio, S., Arboleya Montes, S., Mancabelli, L., Lugli, G. A., Miguel Rodriguez, J., Bode, L., de Vos, W., Gueimonde, M., Margolles, A., van Sinderen, D. & Ventura, M., dec 2017, I : Microbiology and Molecular Biology Reviews. 81, 4, 67 s., ARTN e00036-17.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies

Costea, P. I., Zeller, G., Sunagawa, S., Pelletier, E., Alberti, A., Levenez, F., Tramontano, M., Driessen, M., Hercog, R., Jung, F-E., Kultima, J. R., Hayward, M. R., Coelho, L. P., Allen-Vercoe, E., Bertrand, L., Blaut, M., Brown, J. R. M., Carton, T., Cools-Portier, S., Daigneault, M. & 38 andraDerrien, M., Druesne, A., de Vos, W. M., Finlay, B. B., Flint, H. J., Guarner, F., Hattori, M., Heilig, H., Luna, R. A., Vlieg, J. V. H., Junick, J., Klymiuk, I., Langella, P., Le Chatelier, E., Mai, V., Manichanh, C., Martin, J. C., Mery, C., Morita, H., O'Toole, P. W., Orvain, C., Patil, K. R., Penders, J., Persson, S., Pons, N., Popova, M., Salonen, A., Saulnier, D., Scott, K. P., Singh, B., Slezak, K., Veiga, P., Versalovic, J., Zhao, L., Zoetendal, E. G., Ehrlich, S. D., Dore, J. & Bork, P., nov 2017, I : Nature Biotechnology. 35, 11, s. 1069-+ 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Variation of mucin adhesion, cell surface characteristics, and molecular mechanisms among Lactobacillus plantarum isolated from different habitats

Buntin, N., de Vos, W. M. & Hongpattarakere, T., okt 2017, I : Applied Microbiology and Biotechnology. 101, 20, s. 7663-7674 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2016

Adaptation of Akkermansia muciniphila to the Oxic-Anoxic Interface of the Mucus Layer

Ouwerkerk, J. P., van der Ark, K. C. H., Davids, M., Claassens, N. J., Finestra, T. R., de Vos, W. M. & Belzer, C., dec 2016, I : Applied and Environmental Microbiology. 82, 23, s. 6983-6993 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Akkermansia glycaniphila sp nov., an anaerobic mucin-degrading bacterium isolated from reticulated python faeces

Ouwerkerk, J. P., Aalvink, S., Belzer, C. & de Vos, W. M., nov 2016, I : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 66, s. 4614-4620 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Akkermansia muciniphila: a novel functional microbe with probiotic properties

Gomez-Gallego, C., Pohl, S., Salminen, S., De Vos, W. M. & Kneifel, W., 2016, I : Beneficial Microbes. 7, 4, s. 571-584 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Antibiotic-Induced Gut Microbiota Disruption Decreases TNF-alpha Release by Mononuclear Cells in Healthy Adults

Lankelma, J. M., Belzer, C., Hoogendijk, A. J., de Vos, A. F., de Vos, W. M., van der Poll, T. & Wiersinga, W. J., aug 2016, I : Clinical and translational gastroenterology. 7, 5 s., 186.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Association of Early-Life Antibiotic Use and Protective Effects of Breastfeeding Role of the Intestinal Microbiota

Korpela, K., Salonen, A., Virta, L. J., Kekkonen, R. A. & de Vos, W. M., aug 2016, I : JAMA Pediatrics. 170, 8, s. 750-757 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

CARBOHYDRATE-PRESENTING SELF-ASSEMBLED MONOLAYERS: PREPARATION, ANALYSIS, AND APLICATIONS IN MICROBIOLOGY

Debrassi, A., de Vos, W., Zuilhof, H. & Wennekes, T., 2016, Carbohydrate Nanotechnology. Stine, K. J. (red.). HOBOKEN: John Wiley & Sons Ltd. , s. 1-51 51 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Characterization of Outer Membrane Proteome of Akkermansia muciniphila Reveals Sets of Novel Proteins Exposed to the Human Intestine

Ottman, N., Huuskonen, L., Reunanen, J., Boeren, S., Klievink, J., Smidt, H., Belzer, C. & de Vos, W. M., 26 jul 2016, I : Frontiers in Microbiology. 7, 13 s., 1157.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Comparative genomics and physiology of the butyrate-producing bacterium Intestinimonas butyriciproducens

Nam Bui, T. P., Shetty, S., Lagkouvardos, I., Ritari, J., Chamlagain, B., Douillard, F., Paulin, L. G., Piironen, V., Clavel, T., Plugge, C. M. & de Vos, W. M., 7 okt 2016, I : Environmental microbiology reports. 8, 6, s. 1024-1037 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Complete genome sequence of Enterococcus faecium commensal isolate E1002.

Tytgat, H. L. P., Douillard, F., Laine, P. K. S., Paulin, L. G., Willems, R. J. L. & de Vos, W. M., 2016, I : Genome Announcements. 4, 2, 2 s., e00113-16.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Correlating the Gut Microbiome to Health and Disease

Marques, T. M., Holster, S., Wall, R., König, J., Brummer, R. J. & de Vos, W. M., 2016, The Gut-Brain Axis : Dietary, Probiotic, and Prebiotic Interventions on the Microbiota. Hyland, N. & Stanton, C. (red.). Amsterdam: Elsevier Academic Press, s. 261-291 31 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Discordant temporal development of bacterial phyla and the emergence of core in the fecal microbiota of young children

Cheng, J., Ringel-Kulka, T., Heikamp-de Jong, I., Ringel, Y., Carroll, I., de Vos, W. M., Salojarvi, J. & Satokari, R., apr 2016, I : ISME Journal. 10, 4, s. 1002-1014 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Durable coexistence of donor and recipient strains after fecal microbiota transplantation

Li, S. S., Zhu, A., Benes, V., Costea, P. I., Hercog, R., Hildebrand, F., Huerta-Cepas, J., Nieuwdorp, M., Salojarvi, J., Voigt, A. Y., Zeller, G., Sunagawa, S., de Vos, W. M. & Bork, P., 29 apr 2016, I : Science. 352, 6285, s. 586-589 4 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Faecal Metaproteomic Analysis Reveals a Personalized and Stable Functional Microbiome and Limited Effects of a Probiotic Intervention in Adults

Kolmeder, C. A., Salojarvi, J., Ritari, J., de Been, M., Raes, J., Falony, G., Vieira-Silva, S., Kekkonen, R. A., Corthals, G. L., Palva, A., Salonen, A. & de Vos, W. M., 12 apr 2016, I : PLoS One. 11, 4, 23 s., 0153294.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Harnessing the power of microbial autotrophy

Claassens, N. J., Sousa, D. Z., dos Santos, V. A. P. M., de Vos, W. M. & van der Oost, J., nov 2016, I : Nature Reviews, Microbiology. 14, 11, s. 692-706 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Healthy human gut phageome

Manrique, P., Bolduc, B., Walk, S. T., van der Oost, J., de Vos, W. M. & Young, M. J., 13 sep 2016, I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113, 37, s. 10400-10405 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Integrated In Silico Analysis of Pathway Designs for Synthetic Photo-Electro-Autotrophy

Volpers, M., Claassens, N. J., Noor, E., van der Oost, J., de Vos, W. M., Kengen, S. W. M. & dos Santos, V. A. P. M., 23 jun 2016, I : PLoS One. 11, 6, 25 s., 0157851.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Intestinal microbiome is related to lifetime antibiotic use in Finnish pre-school children

Korpela, K., Salonen, A., Virta, L. J., Kekkonen, R. A., Forslund, K., Bork, P. & de Vos, W. M., jan 2016, I : Nature Communications. 7, 8 s., 10410.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil