Foto på Willem Meindert Vos de

Willem Meindert Vos de

19992019
Om du gjort några ändringar i Pure kommer de visas här snart.

Publikationer 1999 2019

2016

Isolation and whole genome sequencing of a Ruminococcus-like bacterium, associated with irritable bowel syndrome

Hynönen, U., Rasinkangas, P., Satokari, R., Paulin, L., de Vos, W. M., Pietilä, T. E., Kant, R. & Palva, A., jun 2016, I : Anaerobe. 39, s. 60-67 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Lactobacillus plantarum WCFS1 and its host interaction: a dozen years after the genome

van den Nieuwboer, M., van Hemert, S., Claassen, E. & de Vos, W. M., jul 2016, I : Microbial Biotechnology. 9, 4, s. 452-465 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Lactobacillus rhamnosus GG Intake Modifies Preschool Children's Intestinal Microbiota, Alleviates Penicillin-Associated Changes, and Reduces Antibiotic Use

Korpela, K., Salonen, A., Virta, L. J., Kumpu, M., Kekkonen, R. A. & de Vos, W. M., 25 apr 2016, I : PLoS One. 11, 4, 16 s., 0154012.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Lactobacillus rhamnosus GG Outcompetes Enterococcus faecium via Mucus-Binding Pili: Evidence for a Novel and Heterospecific Probiotic Mechanism

Tytgat, H. L. P., Douillard, F. P., Reunanen, J., Rasinkangas, P., Hendrickx, A. P. A., Laine, P. K., Paulin, L., Satokari, R. & de Vos, W. M., okt 2016, I : Applied and Environmental Microbiology. 82, 19, s. 5756-5762 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Polymorphisms, Chromosomal Rearrangements, and Mutator Phenotype Development during Experimental Evolution of Lactobacillus rhamnosus GG

Douillard, F. P., Ribbera, A., Xiao, K., Ritari, J., Rasinkangas, P., Paulin, L., Palva, A., Hao, Y. & de Vos, W. M., jul 2016, I : Applied and Environmental Microbiology. 82, 13, s. 3783-3792 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Probiotic Gut Microbiota Isolate Interacts with Dendritic Cells via Glycosylated Heterotrimeric Pili

Tytgat, H. L. P., van Teijlingen, N. H., Sullan, R. M. A., Douillard, F. P., Rasinkangas, P., Messing, M., Reunanen, J., Satokari, R., Vanderleyden, J., Dufrene, Y. F., Geijtenbeek, T. B. H., de Vos, W. M. & Lebeer, S., 17 mar 2016, I : PLoS One. 11, 3, 19 s., 0151824.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Sucar Coating the Envelope: Glycoconjucates for Microbe-Host Crosstalk

Tytgat, H. L. P. & de Vos, W. M., nov 2016, I : Trends in Microbiology. 24, 11, s. 853-861 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The gut microbiota plays a protective role in the host defence against pneumococcal pneumonia

Schuijt, T. J., Lankelma, J. M., Scicluna, B. P., e Melo, F. D. S., Roelofs, J. J. T. H., de Boer, J. D., Hoogendijk, A. J., de Beer, R., de Vos, A., Belzer, C., de Vos, W. M., van der Poll, T. & Wiersinga, W. J., apr 2016, I : Gut. 65, 4, s. 575-583 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The N-Terminal GYPSY Motif Is Required for Pilin-Specific Sortase SrtC1 Functionality in Lactobacillus rhamnosus Strain GG

Douillard, F. P., Rasinkangas, P., Bhattacharjee, A., Palva, A. & de Vos, W. M., 12 apr 2016, I : PLoS One. 11, 4, 18 s., 0153373.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The Variable Regions of Lactobacillus rhamnosus Genomes Reveal the Dynamic Evolution of Metabolic and Host-Adaptation Repertoires

Ceapa, C., Davids, M., Ritari, J., Lambert, J., Wels, M., Douillard, F. P., Smokvina, T., de Vos, W. M., Knol, J. & Kleerebezem, M., jun 2016, I : Genome Biology and Evolution. 8, 6, s. 1889-1905 17 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Unravelling the one-carbon metabolism of the acetogen Sporomusa strain An4 by genome and proteome analysis

Visser, M., Pieterse, M. M., Pinkse, M. W. H., Nijsse, B., Verhaert, P. D. E. M., de Vos, W. M., Schaap, P. J. & Stams, A. J. M., sep 2016, I : Environmental Microbiology. 18, 9, s. 2843-2855 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2015

Akkermansia muciniphila Adheres to Enterocytes and Strengthens the Integrity of the Epithelial Cell Layer

Reunanen, J., Kainulainen, V., Huuskonen, L., Ottman, N., Belzer, C., Huhtinen, H., de Vos, W. M. & Satokari, R., jun 2015, I : Applied and Environmental Microbiology. 81, 11, s. 3655-3662 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Akkermansia muciniphila and Helicobacter typhlonius modulate intestinal tumor development in mice

Dingemanse, C., Belzer, C., van Hijum, S. A. F. T., Gunthel, M., Salvatori, D., den Dunnen, J. T., Kuijper, E. J., Devilee, P., de Vos, W. M., van Ommen, G. B. & Robanus-Maandag, E. C., nov 2015, I : Carcinogenesis. 36, 11, s. 1388-1396 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Altered faecal and mucosal microbial composition in post-infectious irritable bowel syndrome patients correlates with mucosal lymphocyte phenotypes and psychological distress

Sundin, J., Rangel, I., Fuentes, S., Heikamp-de Jong, I., Hultgren-Hornquist, E., de Vos, W. M. & Brummer, R. J., feb 2015, I : Alimentary Pharmacology & Therapeutics. 41, 4, s. 342-351 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

A novel consortium of Lactobacillus rhamnosus and Streptococcus thermophilus for increased access to functional fermented foods

Kort, R., Westerik, N., Serrano, L. M., Douillard, F. P., Gottstein, W., Mukisa, I. M., Tuijn, C. J., Basten, L., Hafkamp, B., Meijer, W. C., Teusink, B., de Vos, W. M., Reid, G. & Sybesma, W., 8 dec 2015, I : Microbial Cell Factories. 14, 13 s., 195.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Application of the Human Intestinal Tract Chip to the non-human primate gut microbiota

Gonzalez, T. D. J. B., van Passel, M. W. J., Tims, S., Fuentes, S., De Vos, W. M., Smidt, H. & Belzer, C., 2015, I : Beneficial Microbes. 6, 3, s. 271-276 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Colonic metaproteomic signatures of active bacteria and the host in obesity

Kolmeder, C. A., Ritari, J., Verdam, F. J., Muth, T., Keskitalo, S., Varjosalo, M., Fuentes, S., Greve, J. W., Buurman, W. A., Reichl, U., Rapp, E., Martens, L., Palva, A., Salonen, A., Rensen, S. S. & de Vos, W. M., okt 2015, I : Proteomics (Weinheim). 15, 20, s. 3544-3552 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Discovery of intramolecular trans-sialidases in human gut microbiota suggests novel mechanisms of mucosal adaptation

Tailford, L. E., Owen, C. D., Walshaw, J., Crost, E. H., Hardy-Goddard, J., Le Gall, G., de Vos, W. M., Taylor, G. L. & Juge, N., jul 2015, I : Nature Communications. 6, 12 s., 7624.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Effects of bowel cleansing on the intestinal microbiota

Jalanka, J., Salonen, A., Salojärvi, J., Ritari, J., Immonen, O., Marciani, L., Gowland, P., Hoad, C., Garsed, K., Lam, C., Palva, A., Spiller, R. C. & de Vos, W. M., okt 2015, I : Gut. 64, 10, s. 1562-1568 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Expanding the biotechnology potential of lactobacilli through comparative genomics of 213 strains and associated genera

Sun, Z., Harris, H. M. B., McCann, A., Guo, C., Argimon, S., Zhang, W., Yang, X., Jeffery, I. B., Cooney, J. C., Kagawa, T. F., Liu, W., Song, Y., Salvetti, E., Wrobel, A., Rasinkangas, P., Parkhill, J., Rea, M. C., O'Sullivan, O., Ritari, J., Douillard, F. P. & 11 andraRoss, R. P., Yang, R., Briner, A. E., Felis, G. E., de Vos, W. M., Barrangou, R., Klaenhammer, T. R., Caufield, P. W., Cui, Y., Zhang, H. & O'Toole, P. W., sep 2015, I : Nature Communications. 6, 13 s., 8322.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Fat, fibre and cancer risk in African Americans and rural Africans

O'Keefe, S. J. D., Li, J. V., Lahti, L., Ou, J., Carbonero, F., Mohammed, K., Posma, J. M., Kinross, J., Wahl, E., Ruder, E., Vipperla, K., Naidoo, V., Mtshali, L., Tims, S., Puylaert, P. G. B., DeLany, J., Krasinskas, A., Benefiel, A. C., Kaseb, H. O., Newton, K. & 4 andraNicholson, J. K., de Vos, W. M., Gaskins, H. R. & Zoetendal, E. G., apr 2015, I : Nature Communications. 6, 14 s., 6342.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Fecal Microbiota in Pediatric Inflammatory Bowel Disease and Its Relation to Inflammation

Kolho, K-L., Korpela, K., Jaakkola, T., Pichai, M. V. A., Zoetendal, E. G., Salonen, A. & de Vos, W. M., jun 2015, I : American Journal of Gastroenterology. 110, 6, s. 921-930 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Fecal microbiota transplantation as novel therapy in gastroenterology: A systematic review

Rossen, N. G., MacDonald, J. K., de Vries, E. M., D'Haens, G. R., de Vos, W. M., Zoetendal, E. G. & Ponsioen, C. Y., 7 maj 2015, I : World Journal of Gastroenterology. 21, 17, s. 5359-5371 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Findings From a Randomized Controlled Trial of Fecal Transplantation for Patients With Ulcerative Colitis

Rossen, N. G., Fuentes, S., van der Spek, M. J., Tijssen, J. G., Hartman, J. H. A., Duflou, A., Lowenberg, M., van den Brink, G. R., Mathus-Vliegen, E. M. H., de Vos, W. M., Zoetendal, E. G., D'Haens, G. R. & Ponsioen, C. Y., jul 2015, I : Gastroenterology. 149, 1, s. 110-+ 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Helsinki alert of biodiversity and health

von Hertzen, L., Beutler, B., Bienenstock, J., Blaser, M., Cani, P. D., Eriksson, J., Farkkila, M., Haahtela, T., Hanski, I., Jenmalm, M. C., Kere, J., Knip, M., Kontula, K., Koskenvuo, M., Ling, C., Mandrup-Poulsen, T., von Mutius, E., Makela, M. J., Paunio, T., Pershagen, G. & 6 andraRenz, H., Rook, G., Saarela, M., Vaarala, O., Veldhoen, M. & de Vos, W. M., maj 2015, I : Annals of Medicine. 47, 3, s. 218-225 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Improved taxonomic assignment of human intestinal 16S rRNA sequences by a dedicated reference database

Ritari, J., Salojärvi, J., Lahti, L. & de Vos, W. M., 12 dec 2015, I : BMC Genomics. 16, 10 s., 1056.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Intestinal Microbiota And Diet in IBS: Causes, Consequences, or Epiphenomena?

Rajilic-Stojanovic, M., Jonkers, D. M., Salonen, A., Hanevik, K., Raes, J., Jalanka, J., de Vos, W. M., Manichanh, C., Golic, N., Enck, P., Philippou, E., Iraqi, F. A., Clarke, G., Spiller, R. C. & Penders, J., feb 2015, I : American Journal of Gastroenterology. 110, 2, s. 278-287 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Inulin-type fructans modulate intestinal Bifidobacterium species populations and decrease fecal short-chain fatty acids in obese women

Salazar, N., Dewulf, E. M., Neyrinck, A. M., Bindels, L. B., Cani, P. D., Mahillon, J., de Vos, W. M., Thissen, J-P., Gueimonde, M., de Los Reyes-Gavilan, C. G. & Delzenne, N. M., jun 2015, I : Clinical Nutrition. 34, 3, s. 501-507 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Lactic Acid Bacteria and the Human Intestinal Microbiome

Douillard, F. P. & de Vos, W. M., 30 okt 2015, Biotechnology of Lactic Acid Bacteria: Novel applications. Mozzi, F. (red.). 2 red. John Wiley & Sons, Ltd, s. 120-133 14 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Lactobacillus rhamnosus GG and its SpaC pilus adhesin modulate inflammatory responsiveness and TLR-related gene expression in the fetal human gut

Ganguli, K., Collado, M. C., Rautava, J., Lu, L., Satokari, R., von Ossowski, I., Reunanen, J., de Vos, W. M., Palva, A., Isolauri, E., Salminen, S., Walker, W. A. & Rautava, S., apr 2015, I : Pediatric Research. 77, 4, s. 528-535 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Maternal prenatal stress is associated with the infant intestinal microbiota

Zijlmans, M. A. C., Korpela, K., Riksen-Walraven, J. M., de Vos, W. M. & de Weerth, C., mar 2015, I : Psychoneuroendocrinology. 53, s. 233-245 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Metagenomics meets time series analysis: unraveling microbial community dynamics

Faust, K., Lahti, L., Gonze, D., de Vos, W. M. & Raes, J., jun 2015, I : Current Opinion in Microbiology. 25, s. 56-66 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Microbial Signatures in Post-Infectious Irritable Bowel Syndrome - Towards Patient Stratification for Improved Diagnostics and Treatment

Jalanka, J., Salonen, A. M., Fuentes, S. & de Vos, W. M., 2015, I : Gut Microbes. 6, 6, s. 364-369 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Mining microbial metatranscriptomes for expression of antibiotic resistance genes under natural conditions

Versluis, D., D'Andrea, M. M., Garcia, J. R., Leimena, M. M., Hugenholtz, F., Zhang, J., Ozturk, B., Nylund, L., Sipkema, D., van Schaik, W., de Vos, W. M., Kleerebezem, M., Smidt, H. & van Passel, M. W. J., 8 jul 2015, I : Scientific Reports. 5, 10 s., 11981.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Navigating through metaproteomics data: A logbook of database searching

Muth, T., Kolmeder, C. A., Salojarvi, J., Keskitalo, S., Varjosalo, M., Verdam, F. J., Rensen, S. S., Reichl, U., de Vos, W. M., Rapp, E. & Martens, L., okt 2015, I : Proteomics (Weinheim). 15, 20, s. 3439-3453 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Phylogenetic and Metabolic Tracking of Gut Microbiota during Perinatal Development

Del Chierico, F., Vernocchi, P., Petrucca, A., Paci, P., Fuentes, S., Pratico, G., Capuani, G., Masotti, A., Reddel, S., Russo, A., Vallone, C., Salvatori, G., Buffone, E., Signore, F., Rigon, G., Dotta, A., Miccheli, A., de Vos, W. M., Dallapiccola, B. & Putignani, L., 2 sep 2015, I : PLoS One. 10, 9, 26 s., 0137347.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Production of butyrate from lysine and the Amadori product fructoselysine by a human gut commensal

Bui, T. P. N., Ritari, J., Boeren, S., de Waard, P., Plugge, C. M. & de Vos, W. M., dec 2015, I : Nature Communications. 6, 10 s., 10062.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Severity of atopic disease inversely correlates with intestinal microbiota diversity and butyrate-producing bacteria

Nylund, L., Nermes, M., Isolauri, E., Salminen, S., de Vos, W. M. & Satokari, R., feb 2015, I : Allergy : European journal of allergy and clinical immunology. 70, 2, s. 241-244 4 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Suoliston mikrobit hyvässä ja pahassa : 130 vuotta Theodor Escherichin jälkeen

Meri, S. & Vos, W. D., 2015, I : Duodecim. 131, 22, s. 2091-2098 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Systems biology and metabolic engineering of lactic acid bacteria for improved fermented foods

Flahaut, N. A. L. & de Vos, W. M., 2015, Advances in fermented foods and beverages: improving quality, technologies and health benefits. Holzapfel, W. (red.). Woodhead Publishing Limited, s. 177-196 20 s. (Woodhead Publishing Series in Food Science Technology and Nutrition; nr. 265).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

The gut microbiota in internal medicine: implications for health and disease

Lankelma, J. M., Nieuwdorp, M., de Vos, W. M. & Wiersinga, W. J., feb 2015, I : Netherlands Journal of Medicine. 73, 2, s. 61-68 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

The Mucosa-associated Microbiota of PSC Patients is Characterized by Low Diversity and Low Abundance of Uncultured Clostridiales II

Rossen, N. G., Fuentes, S., Boonstra, K., D'Haens, G. R., Heilig, H. G., Zoetendal, E. G., de Vos, W. M. & Ponsioen, C. Y., 1 apr 2015, I : Journal of Crohn's and Colitis. 9, 4, s. 342-348 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

The relationship between faecal-associated and mucosal-associated microbiota in irritable bowel syndrome patients and healthy subjects

Rangel, I., Sundin, J., Fuentes, S., Repsilber, D., de Vos, W. M. & Brummer, R. J., nov 2015, I : Alimentary Pharmacology & Therapeutics. 42, 10, s. 1211-1221 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Versatile (Bio)Functionalization of Bromo-Terminated Phosphonate-Modified Porous Aluminum Oxide

Debrassi, A., Roeven, E., Thijssen, S., Scheres, L., de Vos, W. M., Wennekes, T. & Zuilhof, H., 26 maj 2015, I : Langmuir. 31, 20, s. 5633-5644 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2014

Aberrant gut microbiota composition at the onset of type 1 diabetes in young children

de Goffau, M. C., Fuentes, S., van den Bogert, B., Honkanen, H., de Vos, W. M., Welling, G. W., Hyoty, H. & Harmsen, H. J. M., aug 2014, I : Diabetologia. 57, 8, s. 1569-1577 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Anaerostipes rhamnosivorans sp nov., a human intestinal, butyrate-forming bacterium

Bui, T. P. N., de Vos, W. M. & Plugge, C. M., 1 mar 2014, I : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 64, 3, s. 787-793 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

An integrated catalog of reference genes in the human gut microbiome

Li, J., Jia, H., Cai, X., Zhong, H., Feng, Q., Sunagawa, S., Arumugam, M., Kultima, J. R., Prifti, E., Nielsen, T., Juncker, A. S., Manichanh, C., Chen, B., Zhang, W., Levenez, F., Wang, J., Xu, X., Xiao, L., Liang, S., Zhang, D. & 19 andraZhang, Z., Chen, W., Zhao, H., Al-Aama, J. Y., Edris, S., Yang, H., Wang, J., Hansen, T., Nielsen, H. B., Brunak, S., Kristiansen, K., Guarner, F., Pedersen, O., Dore, J., Ehrlich, S. D., Bork, P., Wang, J., MetaHIT Consortium & Vos de, W. M., aug 2014, I : Nature Biotechnology. 32, 8, 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Differential Modulation by Akkermansia muciniphila and Faecalibacterium prausnitzii of Host Peripheral Lipid Metabolism and Histone Acetylation in Mouse Gut Organoids

Lukovac, S., Belzer, C., Pellis, L., Keijser, B. J., de Vos, W. M., Montijn, R. C. & Roeselers, G., 2014, I : mBio. 5, 4, 10 s., UNSP e01438-14.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil