Projekt per år
Projektinformation
Beskrivning (abstrakt)
Sequencing the nuclear and mitochondrial genome of the wild type heterokaryon Finnish isolate 79 of the wood-decaying white rot Basidiomycota genus type species Phlebia radiata. Analysis of the wood-decaying proteome and secretome.
Viktiga resultat
Mitochondrial genome is the second largest among fungi with exceptional features. High-quality genome assembly of the wild type heterokaryon isolate.
| Kort titel | Prad genome |
|---|---|
| Status | Slutfört |
| Gällande start-/slutdatum | 03/01/2011 → 31/12/2017 |
Vetenskapsgrenar
- 1183 Växtbiologi, mikrobiologi, virologi
- 1181 Ekologi, evolutionsbiologi
- 1182 Biokemi, cell- och molekylärbiologi
- 1184 Genetik, utvecklingsbiologi, fysiologi
Utrustning
-
Genome-wide technology platform / DNA Sequencing and genomics laboratory
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Utrustning
-
Proteomics and protein characterization technology platform / Proteomics unit
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Utrustning
Projekt
- 2 Slutfört
-
Fungcolife: Sienten vuorovaikutukset ja elintavat puussa: aktiivisuuksien, proteomin ja transkriptomin muutokset yhteiskasvatuksissa ja yhteisöissä
Lundell, T., Mali, T., Mattila, H., Shah, F. & Mäkinen, M.
01/09/2015 → 31/12/2019
Projekt: Forskningsprojekt
-
Ox-Red: Hapetus-pelkistysentsyymigeenien sammutus valkolahosienessa
Lundell, T., Oksanen, I., Kuuskeri, J., Mäkelä, M., Hilden, K., Mäkinen, M. & Paulin, L.
01/01/2011 → 30/06/2015
Projekt: Forskningsprojekt
-
Hypoxia is regulating enzymatic wood decomposition and intracellular carbohydrate metabolism in filamentous white rot fungus
Mattila, H., Mäkinen, M. & Lundell, T., 24 feb. 2020, I: Biotechnology for Biofuels. 13, 1, 17 s., 26.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Time-scale dynamics of proteome and transcriptome of the white-rot fungus Phlebia radiata: growth on spruce wood and decay effect on lignocellulose
Kuuskeri, J., Häkkinen, M., Laine, P., Smolander, O-P., Tamene, F., Miettinen, S., Nousiainen, P., Kemell, M., Auvinen, P. & Lundell, T., 5 sep. 2016, I: Biotechnology for Biofuels. 9, 22 s., 192.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Lignocellulose-converting enzyme activity profiles correlate with molecular systematics and phylogeny grouping in the incoherent genus Phlebia (Polyporales, Basidiomycota)
Kuuskeri, J. T., Mäkelä, M. R., Isotalo, J. M., Oksanen, I. M. & Lundell, T. K., 19 okt. 2015, I: BMC Microbiology. 15, 18 s., 217.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil