Projekt per år
Projektinformation
Beskrivning (abstrakt)
Sequencing the nuclear and mitochondrial genome of the wild type heterokaryon Finnish isolate 79 of the wood-decaying white rot Basidiomycota genus type species Phlebia radiata. Analysis of the wood-decaying proteome and secretome.
Viktiga resultat
Mitochondrial genome is the second largest among fungi with exceptional features. High-quality genome assembly of the wild type heterokaryon isolate.
| Kort titel | Prad genome |
|---|---|
| Status | Slutfört |
| Gällande start-/slutdatum | 03/01/2011 → 31/12/2017 |
Vetenskapsgrenar
- 1183 Växtbiologi, mikrobiologi, virologi
- 1181 Ekologi, evolutionsbiologi
- 1182 Biokemi, cell- och molekylärbiologi
- 1184 Genetik, utvecklingsbiologi, fysiologi
Utrustning
-
BI Proteomic Unit (LS-RIA/ PPN Helsinki)
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
DNA Genomics and Sequencing (LS-RIA/ HGI)
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
Projekt
- 2 Slutfört
-
Fungcolife: Sienten vuorovaikutukset ja elintavat puussa: aktiivisuuksien, proteomin ja transkriptomin muutokset yhteiskasvatuksissa ja yhteisöissä
Lundell, T. (Projektledare), Mali, T. (Deltagare), Mattila, H. (Deltagare), Shah, F. (Deltagare) & Mäkinen, M. (Deltagare)
01/09/2015 → 31/12/2019
Projekt: Forskningsprojekt
-
Ox-Red: Hapetus-pelkistysentsyymigeenien sammutus valkolahosienessa
Lundell, T. (Projektledare), Oksanen, I. (Deltagare), Kuuskeri, J. (Deltagare), Mäkelä, M. (Deltagare), Hilden, K. (Deltagare), Mäkinen, M. (Deltagare) & Paulin, L. (Deltagare)
01/01/2011 → 30/06/2015
Projekt: Forskningsprojekt
-
Hypoxia is regulating enzymatic wood decomposition and intracellular carbohydrate metabolism in filamentous white rot fungus
Mattila, H., Mäkinen, M. & Lundell, T., 24 feb. 2020, I: Biotechnology for Biofuels. 13, 1, 17 s., 26.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Time-scale dynamics of proteome and transcriptome of the white-rot fungus Phlebia radiata: growth on spruce wood and decay effect on lignocellulose
Kuuskeri, J., Häkkinen, M., Laine, P., Smolander, O.-P., Tamene, F., Miettinen, S., Nousiainen, P., Kemell, M., Auvinen, P. & Lundell, T., 5 sep. 2016, I: Biotechnology for Biofuels. 9, 22 s., 192.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Lignocellulose-converting enzyme activity profiles correlate with molecular systematics and phylogeny grouping in the incoherent genus Phlebia (Polyporales, Basidiomycota)
Kuuskeri, J. T., Mäkelä, M. R., Isotalo, J. M., Oksanen, I. M. & Lundell, T. K., 19 okt. 2015, I: BMC Microbiology. 15, 18 s., 217.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil