Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT)

J Alneberg, BS Bjarnason, I de Bruijn, M Schirmer, J Quick, Umer Ijaz, Leo Mikael Lahti, NJ Loman, AF Andersson, Christopher Quince

Forskningsoutput: Icke-textbaserad outputProgramvaraVetenskaplig

Sammanfattning

A program for unsupervised binning of metagenomic contigs by using nucleotide composition, coverage data in multiple samples and linkage data from paired end reads.
Originalspråkengelska
StatusPublicerad - 2014
MoE-publikationstypI2 ICT-programvara

Vetenskapsgrenar

  • 113 Data- och informationsvetenskap

Citera det här

Alneberg, J. (Författare), Bjarnason, BS. (Författare), de Bruijn, I. (Författare), Schirmer, M. (Författare), Quick, J. (Författare), Ijaz, U. (Författare), Lahti, L. M. (Författare), Loman, NJ. (Författare), Andersson, AF. (Författare), & Quince, C. (Författare). (2014). Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT). Programvara https://github.com/BinPro/CONCOCT